Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT62

ATG3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG3Q9NT62 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ATG3Q9NT62 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ATG3Q9NT62 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ATG3Q9NT62 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ATG3Q9NT62 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ATG3Q9NT62 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ATG3Q9NT62 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ATG3Q9NT62 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ATG3Q9NT62 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
ATG3Q9NT62 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ATG3Q9NT62 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ATG3Q9NT62 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ATG3Q9NT62 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ATG3Q9NT62 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ATG3Q9NT62 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ATG3Q9NT62 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ATG3Q9NT62 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ATG3Q9NT62 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ATG3Q9NT62 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ATG3Q9NT62 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ATG3Q9NT62 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ATG3Q9NT62 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ATG3Q9NT62 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ATG3Q9NT62 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ATG3Q9NT62 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ATG3Q9NT62 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ATG3Q9NT62 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ATG3Q9NT62 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ATG3Q9NT62 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ATG3Q9NT62 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ATG3Q9NT62 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ATG3Q9NT62 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ATG3Q9NT62 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ATG3Q9NT62 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ATG3Q9NT62 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ATG3Q9NT62 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ATG3Q9NT62 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ATG3Q9NT62 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ATG3Q9NT62 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
ATG3Q9NT62 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ATG3Q9NT62 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
ATG3Q9NT62 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ATG3Q9NT62 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ATG3Q9NT62 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ATG3Q9NT62 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ATG3Q9NT62 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
ATG3Q9NT62 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ATG3Q9NT62 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ATG3Q9NT62 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ATG3Q9NT62 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ATG3Q9NT62 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ATG3Q9NT62 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ATG3Q9NT62 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ATG3Q9NT62 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ATG3Q9NT62 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ATG3Q9NT62 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ATG3Q9NT62 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
ATG3Q9NT62 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ATG3Q9NT62 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ATG3Q9NT62 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ATG3Q9NT62 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ATG3Q9NT62 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ATG3Q9NT62 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ATG3Q9NT62 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ATG3Q9NT62 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ATG3Q9NT62 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ATG3Q9NT62 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ATG3Q9NT62 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ATG3Q9NT62 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
ATG3Q9NT62 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
ATG3Q9NT62 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
ATG3Q9NT62 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
ATG3Q9NT62 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
ATG3Q9NT62 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ATG3Q9NT62 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ATG3Q9NT62 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ATG3Q9NT62 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ATG3Q9NT62 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
ATG3Q9NT62 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
ATG3Q9NT62 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ATG3Q9NT62 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
ATG3Q9NT62 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
ATG3Q9NT62 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ATG3Q9NT62 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ATG3Q9NT62 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ATG3Q9NT62 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ATG3Q9NT62 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ATG3Q9NT62 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ATG3Q9NT62 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ATG3Q9NT62 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ATG3Q9NT62 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ATG3Q9NT62 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ATG3Q9NT62 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ATG3Q9NT62 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ATG3Q9NT62 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ATG3Q9NT62 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
ATG3Q9NT62 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ATG3Q9NT62 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ATG3Q9NT62 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ATG3Q9NT62 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.4 ms