Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSA3

CTNNBIP1, Beta-catenin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNBIP1Q9NSA3 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
CTNNBIP1Q9NSA3 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC12.82□□□□□ -0.36
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
CTNNBIP1Q9NSA3 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
CTNNBIP1Q9NSA3 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
CTNNBIP1Q9NSA3 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
CTNNBIP1Q9NSA3 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC12.82□□□□□ -0.36
CTNNBIP1Q9NSA3 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
CTNNBIP1Q9NSA3 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
CTNNBIP1Q9NSA3 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
CTNNBIP1Q9NSA3 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
CTNNBIP1Q9NSA3 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
CTNNBIP1Q9NSA3 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
CTNNBIP1Q9NSA3 OTOF-202ENST00000338581 4954 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
CTNNBIP1Q9NSA3 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
CTNNBIP1Q9NSA3 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
CTNNBIP1Q9NSA3 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
CTNNBIP1Q9NSA3 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
CTNNBIP1Q9NSA3 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
CTNNBIP1Q9NSA3 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
CTNNBIP1Q9NSA3 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
CTNNBIP1Q9NSA3 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
CTNNBIP1Q9NSA3 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
CTNNBIP1Q9NSA3 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
CTNNBIP1Q9NSA3 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
CTNNBIP1Q9NSA3 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
CTNNBIP1Q9NSA3 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
CTNNBIP1Q9NSA3 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
CTNNBIP1Q9NSA3 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
CTNNBIP1Q9NSA3 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
CTNNBIP1Q9NSA3 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
CTNNBIP1Q9NSA3 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
CTNNBIP1Q9NSA3 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
CTNNBIP1Q9NSA3 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
CTNNBIP1Q9NSA3 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
CTNNBIP1Q9NSA3 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
CTNNBIP1Q9NSA3 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
CTNNBIP1Q9NSA3 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
CTNNBIP1Q9NSA3 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
CTNNBIP1Q9NSA3 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
CTNNBIP1Q9NSA3 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
CTNNBIP1Q9NSA3 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
CTNNBIP1Q9NSA3 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
CTNNBIP1Q9NSA3 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
CTNNBIP1Q9NSA3 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
CTNNBIP1Q9NSA3 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
CTNNBIP1Q9NSA3 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
CTNNBIP1Q9NSA3 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
CTNNBIP1Q9NSA3 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
CTNNBIP1Q9NSA3 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
CTNNBIP1Q9NSA3 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
CTNNBIP1Q9NSA3 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
CTNNBIP1Q9NSA3 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
CTNNBIP1Q9NSA3 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
CTNNBIP1Q9NSA3 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC12.81□□□□□ -0.36
CTNNBIP1Q9NSA3 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
CTNNBIP1Q9NSA3 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
CTNNBIP1Q9NSA3 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
CTNNBIP1Q9NSA3 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
CTNNBIP1Q9NSA3 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
CTNNBIP1Q9NSA3 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
CTNNBIP1Q9NSA3 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
CTNNBIP1Q9NSA3 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
CTNNBIP1Q9NSA3 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
CTNNBIP1Q9NSA3 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
CTNNBIP1Q9NSA3 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
CTNNBIP1Q9NSA3 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
CTNNBIP1Q9NSA3 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
CTNNBIP1Q9NSA3 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
CTNNBIP1Q9NSA3 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
CTNNBIP1Q9NSA3 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
CTNNBIP1Q9NSA3 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
CTNNBIP1Q9NSA3 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
CTNNBIP1Q9NSA3 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
CTNNBIP1Q9NSA3 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
CTNNBIP1Q9NSA3 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
CTNNBIP1Q9NSA3 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
CTNNBIP1Q9NSA3 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
CTNNBIP1Q9NSA3 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
CTNNBIP1Q9NSA3 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
CTNNBIP1Q9NSA3 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
CTNNBIP1Q9NSA3 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
CTNNBIP1Q9NSA3 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
CTNNBIP1Q9NSA3 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
CTNNBIP1Q9NSA3 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
CTNNBIP1Q9NSA3 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
CTNNBIP1Q9NSA3 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
CTNNBIP1Q9NSA3 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
CTNNBIP1Q9NSA3 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
CTNNBIP1Q9NSA3 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
CTNNBIP1Q9NSA3 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
CTNNBIP1Q9NSA3 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
CTNNBIP1Q9NSA3 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
CTNNBIP1Q9NSA3 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
CTNNBIP1Q9NSA3 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
CTNNBIP1Q9NSA3 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms