Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRW1

RAB6B, Ras-related protein Rab-6B, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6BQ9NRW1 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB6BQ9NRW1 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB6BQ9NRW1 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB6BQ9NRW1 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB6BQ9NRW1 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB6BQ9NRW1 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB6BQ9NRW1 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB6BQ9NRW1 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB6BQ9NRW1 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB6BQ9NRW1 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB6BQ9NRW1 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB6BQ9NRW1 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB6BQ9NRW1 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB6BQ9NRW1 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB6BQ9NRW1 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB6BQ9NRW1 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB6BQ9NRW1 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB6BQ9NRW1 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB6BQ9NRW1 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB6BQ9NRW1 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB6BQ9NRW1 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB6BQ9NRW1 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB6BQ9NRW1 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB6BQ9NRW1 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB6BQ9NRW1 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB6BQ9NRW1 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB6BQ9NRW1 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB6BQ9NRW1 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB6BQ9NRW1 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB6BQ9NRW1 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB6BQ9NRW1 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB6BQ9NRW1 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB6BQ9NRW1 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB6BQ9NRW1 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB6BQ9NRW1 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB6BQ9NRW1 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB6BQ9NRW1 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB6BQ9NRW1 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB6BQ9NRW1 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB6BQ9NRW1 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB6BQ9NRW1 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB6BQ9NRW1 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB6BQ9NRW1 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB6BQ9NRW1 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB6BQ9NRW1 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB6BQ9NRW1 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB6BQ9NRW1 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB6BQ9NRW1 STK33P1-201ENST00000423835 1218 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB6BQ9NRW1 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB6BQ9NRW1 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB6BQ9NRW1 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB6BQ9NRW1 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB6BQ9NRW1 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB6BQ9NRW1 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB6BQ9NRW1 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB6BQ9NRW1 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB6BQ9NRW1 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB6BQ9NRW1 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB6BQ9NRW1 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB6BQ9NRW1 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB6BQ9NRW1 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB6BQ9NRW1 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB6BQ9NRW1 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB6BQ9NRW1 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB6BQ9NRW1 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB6BQ9NRW1 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB6BQ9NRW1 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB6BQ9NRW1 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB6BQ9NRW1 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB6BQ9NRW1 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB6BQ9NRW1 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB6BQ9NRW1 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB6BQ9NRW1 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB6BQ9NRW1 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB6BQ9NRW1 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB6BQ9NRW1 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB6BQ9NRW1 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB6BQ9NRW1 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB6BQ9NRW1 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB6BQ9NRW1 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB6BQ9NRW1 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB6BQ9NRW1 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB6BQ9NRW1 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB6BQ9NRW1 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB6BQ9NRW1 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB6BQ9NRW1 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB6BQ9NRW1 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB6BQ9NRW1 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB6BQ9NRW1 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB6BQ9NRW1 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB6BQ9NRW1 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB6BQ9NRW1 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB6BQ9NRW1 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB6BQ9NRW1 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB6BQ9NRW1 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB6BQ9NRW1 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB6BQ9NRW1 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB6BQ9NRW1 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB6BQ9NRW1 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB6BQ9NRW1 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms