Protein–RNA interactions for Protein: Q9HD43

PTPRH, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase H, humanhuman

Predictions only

Length 1,115 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRHQ9HD43 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPRHQ9HD43 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPRHQ9HD43 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPRHQ9HD43 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPRHQ9HD43 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPRHQ9HD43 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPRHQ9HD43 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPRHQ9HD43 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPRHQ9HD43 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPRHQ9HD43 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPRHQ9HD43 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPRHQ9HD43 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPRHQ9HD43 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPRHQ9HD43 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPRHQ9HD43 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPRHQ9HD43 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPRHQ9HD43 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPRHQ9HD43 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPRHQ9HD43 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPRHQ9HD43 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPRHQ9HD43 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPRHQ9HD43 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPRHQ9HD43 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRHQ9HD43 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRHQ9HD43 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRHQ9HD43 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRHQ9HD43 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRHQ9HD43 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRHQ9HD43 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRHQ9HD43 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRHQ9HD43 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRHQ9HD43 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRHQ9HD43 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRHQ9HD43 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRHQ9HD43 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRHQ9HD43 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRHQ9HD43 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRHQ9HD43 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRHQ9HD43 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRHQ9HD43 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRHQ9HD43 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRHQ9HD43 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRHQ9HD43 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRHQ9HD43 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRHQ9HD43 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRHQ9HD43 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRHQ9HD43 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRHQ9HD43 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRHQ9HD43 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRHQ9HD43 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRHQ9HD43 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRHQ9HD43 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRHQ9HD43 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRHQ9HD43 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRHQ9HD43 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRHQ9HD43 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRHQ9HD43 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRHQ9HD43 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRHQ9HD43 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRHQ9HD43 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRHQ9HD43 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRHQ9HD43 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRHQ9HD43 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRHQ9HD43 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPRHQ9HD43 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPRHQ9HD43 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPRHQ9HD43 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPRHQ9HD43 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPRHQ9HD43 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPRHQ9HD43 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPRHQ9HD43 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPRHQ9HD43 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPRHQ9HD43 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPRHQ9HD43 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPRHQ9HD43 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPRHQ9HD43 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPRHQ9HD43 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPRHQ9HD43 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPRHQ9HD43 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPRHQ9HD43 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPRHQ9HD43 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPRHQ9HD43 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPRHQ9HD43 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPRHQ9HD43 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPRHQ9HD43 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPRHQ9HD43 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPRHQ9HD43 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPRHQ9HD43 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPRHQ9HD43 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPRHQ9HD43 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPRHQ9HD43 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPRHQ9HD43 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPRHQ9HD43 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPRHQ9HD43 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPRHQ9HD43 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPRHQ9HD43 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPRHQ9HD43 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPRHQ9HD43 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPRHQ9HD43 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPRHQ9HD43 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
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