Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZN8

C20orf27, UPF0687 protein C20orf27, humanhuman

Predictions only

Length 174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C20orf27Q9GZN8 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C20orf27Q9GZN8 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
C20orf27Q9GZN8 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C20orf27Q9GZN8 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C20orf27Q9GZN8 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C20orf27Q9GZN8 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C20orf27Q9GZN8 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C20orf27Q9GZN8 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
C20orf27Q9GZN8 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C20orf27Q9GZN8 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C20orf27Q9GZN8 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C20orf27Q9GZN8 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C20orf27Q9GZN8 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C20orf27Q9GZN8 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C20orf27Q9GZN8 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C20orf27Q9GZN8 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C20orf27Q9GZN8 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C20orf27Q9GZN8 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C20orf27Q9GZN8 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
C20orf27Q9GZN8 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C20orf27Q9GZN8 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C20orf27Q9GZN8 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C20orf27Q9GZN8 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C20orf27Q9GZN8 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C20orf27Q9GZN8 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C20orf27Q9GZN8 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C20orf27Q9GZN8 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C20orf27Q9GZN8 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C20orf27Q9GZN8 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C20orf27Q9GZN8 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C20orf27Q9GZN8 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
C20orf27Q9GZN8 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C20orf27Q9GZN8 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
C20orf27Q9GZN8 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C20orf27Q9GZN8 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C20orf27Q9GZN8 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
C20orf27Q9GZN8 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C20orf27Q9GZN8 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C20orf27Q9GZN8 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C20orf27Q9GZN8 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C20orf27Q9GZN8 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
C20orf27Q9GZN8 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C20orf27Q9GZN8 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C20orf27Q9GZN8 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C20orf27Q9GZN8 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C20orf27Q9GZN8 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C20orf27Q9GZN8 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C20orf27Q9GZN8 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C20orf27Q9GZN8 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C20orf27Q9GZN8 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
C20orf27Q9GZN8 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C20orf27Q9GZN8 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C20orf27Q9GZN8 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C20orf27Q9GZN8 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
C20orf27Q9GZN8 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
C20orf27Q9GZN8 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C20orf27Q9GZN8 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C20orf27Q9GZN8 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C20orf27Q9GZN8 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C20orf27Q9GZN8 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C20orf27Q9GZN8 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
C20orf27Q9GZN8 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C20orf27Q9GZN8 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C20orf27Q9GZN8 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C20orf27Q9GZN8 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C20orf27Q9GZN8 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C20orf27Q9GZN8 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C20orf27Q9GZN8 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C20orf27Q9GZN8 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
C20orf27Q9GZN8 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C20orf27Q9GZN8 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C20orf27Q9GZN8 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C20orf27Q9GZN8 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C20orf27Q9GZN8 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C20orf27Q9GZN8 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C20orf27Q9GZN8 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
C20orf27Q9GZN8 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C20orf27Q9GZN8 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
C20orf27Q9GZN8 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C20orf27Q9GZN8 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C20orf27Q9GZN8 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C20orf27Q9GZN8 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C20orf27Q9GZN8 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C20orf27Q9GZN8 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C20orf27Q9GZN8 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C20orf27Q9GZN8 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C20orf27Q9GZN8 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C20orf27Q9GZN8 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C20orf27Q9GZN8 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C20orf27Q9GZN8 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C20orf27Q9GZN8 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C20orf27Q9GZN8 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
C20orf27Q9GZN8 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
C20orf27Q9GZN8 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C20orf27Q9GZN8 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
C20orf27Q9GZN8 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C20orf27Q9GZN8 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C20orf27Q9GZN8 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C20orf27Q9GZN8 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C20orf27Q9GZN8 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms