Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D0

PHACTR1, Phosphatase and actin regulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHACTR1Q9C0D0 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PHACTR1Q9C0D0 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PHACTR1Q9C0D0 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PHACTR1Q9C0D0 RUFY1-202ENST00000393438 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PHACTR1Q9C0D0 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PHACTR1Q9C0D0 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PHACTR1Q9C0D0 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PHACTR1Q9C0D0 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PHACTR1Q9C0D0 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PHACTR1Q9C0D0 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PHACTR1Q9C0D0 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PHACTR1Q9C0D0 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PHACTR1Q9C0D0 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PHACTR1Q9C0D0 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PHACTR1Q9C0D0 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PHACTR1Q9C0D0 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PHACTR1Q9C0D0 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PHACTR1Q9C0D0 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PHACTR1Q9C0D0 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PHACTR1Q9C0D0 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PHACTR1Q9C0D0 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PHACTR1Q9C0D0 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PHACTR1Q9C0D0 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PHACTR1Q9C0D0 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PHACTR1Q9C0D0 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PHACTR1Q9C0D0 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PHACTR1Q9C0D0 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PHACTR1Q9C0D0 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PHACTR1Q9C0D0 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PHACTR1Q9C0D0 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PHACTR1Q9C0D0 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PHACTR1Q9C0D0 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PHACTR1Q9C0D0 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PHACTR1Q9C0D0 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PHACTR1Q9C0D0 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PHACTR1Q9C0D0 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PHACTR1Q9C0D0 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PHACTR1Q9C0D0 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PHACTR1Q9C0D0 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PHACTR1Q9C0D0 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PHACTR1Q9C0D0 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PHACTR1Q9C0D0 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PHACTR1Q9C0D0 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PHACTR1Q9C0D0 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PHACTR1Q9C0D0 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PHACTR1Q9C0D0 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PHACTR1Q9C0D0 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PHACTR1Q9C0D0 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PHACTR1Q9C0D0 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PHACTR1Q9C0D0 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PHACTR1Q9C0D0 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PHACTR1Q9C0D0 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PHACTR1Q9C0D0 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PHACTR1Q9C0D0 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PHACTR1Q9C0D0 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PHACTR1Q9C0D0 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PHACTR1Q9C0D0 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PHACTR1Q9C0D0 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PHACTR1Q9C0D0 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PHACTR1Q9C0D0 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PHACTR1Q9C0D0 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PHACTR1Q9C0D0 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PHACTR1Q9C0D0 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PHACTR1Q9C0D0 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PHACTR1Q9C0D0 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PHACTR1Q9C0D0 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PHACTR1Q9C0D0 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PHACTR1Q9C0D0 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PHACTR1Q9C0D0 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PHACTR1Q9C0D0 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PHACTR1Q9C0D0 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PHACTR1Q9C0D0 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PHACTR1Q9C0D0 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PHACTR1Q9C0D0 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PHACTR1Q9C0D0 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PHACTR1Q9C0D0 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PHACTR1Q9C0D0 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PHACTR1Q9C0D0 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PHACTR1Q9C0D0 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PHACTR1Q9C0D0 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PHACTR1Q9C0D0 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PHACTR1Q9C0D0 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PHACTR1Q9C0D0 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PHACTR1Q9C0D0 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PHACTR1Q9C0D0 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PHACTR1Q9C0D0 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PHACTR1Q9C0D0 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PHACTR1Q9C0D0 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PHACTR1Q9C0D0 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PHACTR1Q9C0D0 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PHACTR1Q9C0D0 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PHACTR1Q9C0D0 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PHACTR1Q9C0D0 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PHACTR1Q9C0D0 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PHACTR1Q9C0D0 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PHACTR1Q9C0D0 AL589935.2-201ENST00000616471 1231 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PHACTR1Q9C0D0 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PHACTR1Q9C0D0 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PHACTR1Q9C0D0 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PHACTR1Q9C0D0 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms