Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY11

PACSIN1, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN1Q9BY11 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PACSIN1Q9BY11 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PACSIN1Q9BY11 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PACSIN1Q9BY11 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PACSIN1Q9BY11 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
PACSIN1Q9BY11 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PACSIN1Q9BY11 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PACSIN1Q9BY11 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PACSIN1Q9BY11 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
PACSIN1Q9BY11 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PACSIN1Q9BY11 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PACSIN1Q9BY11 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PACSIN1Q9BY11 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PACSIN1Q9BY11 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PACSIN1Q9BY11 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PACSIN1Q9BY11 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PACSIN1Q9BY11 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PACSIN1Q9BY11 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PACSIN1Q9BY11 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PACSIN1Q9BY11 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PACSIN1Q9BY11 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PACSIN1Q9BY11 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
PACSIN1Q9BY11 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PACSIN1Q9BY11 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PACSIN1Q9BY11 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PACSIN1Q9BY11 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PACSIN1Q9BY11 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PACSIN1Q9BY11 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PACSIN1Q9BY11 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PACSIN1Q9BY11 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PACSIN1Q9BY11 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PACSIN1Q9BY11 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PACSIN1Q9BY11 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PACSIN1Q9BY11 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PACSIN1Q9BY11 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PACSIN1Q9BY11 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PACSIN1Q9BY11 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PACSIN1Q9BY11 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PACSIN1Q9BY11 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PACSIN1Q9BY11 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PACSIN1Q9BY11 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PACSIN1Q9BY11 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PACSIN1Q9BY11 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PACSIN1Q9BY11 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PACSIN1Q9BY11 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PACSIN1Q9BY11 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PACSIN1Q9BY11 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PACSIN1Q9BY11 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PACSIN1Q9BY11 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PACSIN1Q9BY11 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PACSIN1Q9BY11 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PACSIN1Q9BY11 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PACSIN1Q9BY11 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PACSIN1Q9BY11 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PACSIN1Q9BY11 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PACSIN1Q9BY11 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PACSIN1Q9BY11 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PACSIN1Q9BY11 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PACSIN1Q9BY11 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PACSIN1Q9BY11 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PACSIN1Q9BY11 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PACSIN1Q9BY11 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PACSIN1Q9BY11 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PACSIN1Q9BY11 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PACSIN1Q9BY11 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PACSIN1Q9BY11 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PACSIN1Q9BY11 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PACSIN1Q9BY11 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PACSIN1Q9BY11 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PACSIN1Q9BY11 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PACSIN1Q9BY11 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PACSIN1Q9BY11 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PACSIN1Q9BY11 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PACSIN1Q9BY11 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PACSIN1Q9BY11 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PACSIN1Q9BY11 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PACSIN1Q9BY11 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PACSIN1Q9BY11 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PACSIN1Q9BY11 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PACSIN1Q9BY11 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PACSIN1Q9BY11 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PACSIN1Q9BY11 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PACSIN1Q9BY11 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PACSIN1Q9BY11 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PACSIN1Q9BY11 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PACSIN1Q9BY11 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PACSIN1Q9BY11 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PACSIN1Q9BY11 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PACSIN1Q9BY11 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PACSIN1Q9BY11 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PACSIN1Q9BY11 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
PACSIN1Q9BY11 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PACSIN1Q9BY11 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PACSIN1Q9BY11 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PACSIN1Q9BY11 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PACSIN1Q9BY11 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PACSIN1Q9BY11 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PACSIN1Q9BY11 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PACSIN1Q9BY11 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PACSIN1Q9BY11 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms