Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW4

MAP1LC3C, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3C, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3CQ9BXW4 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 TECTA-201ENST00000264037 6468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 TNN-202ENST00000621086 4234 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 C8orf31-201ENST00000395172 1875 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 IKZF1-204ENST00000349824 5757 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 CPT1B-202ENST00000360719 2319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 MRVI1-204ENST00000527509 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 CAP2-209ENST00000616440 2776 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 ADCY8-202ENST00000377928 3363 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 CAMK2B-217ENST00000457475 4142 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 PCDHA5-203ENST00000614258 4248 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 ROBO1-213ENST00000618846 7483 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 MYRF-202ENST00000278836 5927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 STAG3-206ENST00000426455 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 MAP7-202ENST00000432797 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 HACD2-201ENST00000383657 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 FAM219B-201ENST00000357635 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 VIPR1-202ENST00000433647 3161 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 PRMT3-202ENST00000331079 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 NISCH-207ENST00000479054 5173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 ARPIN-201ENST00000357484 7591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 SNAP29-201ENST00000215730 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 RAPH1-213ENST00000630330 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 PRRT3-203ENST00000412055 3761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 ZHX2-201ENST00000314393 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 PLA2G3-201ENST00000215885 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 SFI1-229ENST00000540643 4226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 AL357143.1-202ENST00000640531 5777 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 GP6-201ENST00000310373 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 FAAP100-201ENST00000327787 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 TP53I11-222ENST00000616990 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 ARRB1-202ENST00000420843 3336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 PDE2A-206ENST00000444035 4193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 CACNA1G-226ENST00000513689 6879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 CACNA1G-231ENST00000515165 6870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 C19orf57-204ENST00000586783 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.8 ms