Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXE9

VN1R3, Vomeronasal type-1 receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VN1R3Q9BXE9 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VN1R3Q9BXE9 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
VN1R3Q9BXE9 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
VN1R3Q9BXE9 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
VN1R3Q9BXE9 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
VN1R3Q9BXE9 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
VN1R3Q9BXE9 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
VN1R3Q9BXE9 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
VN1R3Q9BXE9 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VN1R3Q9BXE9 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VN1R3Q9BXE9 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VN1R3Q9BXE9 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VN1R3Q9BXE9 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
VN1R3Q9BXE9 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VN1R3Q9BXE9 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VN1R3Q9BXE9 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VN1R3Q9BXE9 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
VN1R3Q9BXE9 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
VN1R3Q9BXE9 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VN1R3Q9BXE9 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
VN1R3Q9BXE9 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VN1R3Q9BXE9 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VN1R3Q9BXE9 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VN1R3Q9BXE9 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VN1R3Q9BXE9 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VN1R3Q9BXE9 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VN1R3Q9BXE9 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VN1R3Q9BXE9 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VN1R3Q9BXE9 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VN1R3Q9BXE9 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VN1R3Q9BXE9 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VN1R3Q9BXE9 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VN1R3Q9BXE9 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VN1R3Q9BXE9 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VN1R3Q9BXE9 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VN1R3Q9BXE9 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VN1R3Q9BXE9 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VN1R3Q9BXE9 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VN1R3Q9BXE9 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
VN1R3Q9BXE9 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VN1R3Q9BXE9 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VN1R3Q9BXE9 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
VN1R3Q9BXE9 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VN1R3Q9BXE9 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VN1R3Q9BXE9 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VN1R3Q9BXE9 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
VN1R3Q9BXE9 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VN1R3Q9BXE9 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VN1R3Q9BXE9 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VN1R3Q9BXE9 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VN1R3Q9BXE9 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VN1R3Q9BXE9 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VN1R3Q9BXE9 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VN1R3Q9BXE9 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
VN1R3Q9BXE9 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
VN1R3Q9BXE9 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VN1R3Q9BXE9 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VN1R3Q9BXE9 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
VN1R3Q9BXE9 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VN1R3Q9BXE9 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VN1R3Q9BXE9 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VN1R3Q9BXE9 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VN1R3Q9BXE9 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VN1R3Q9BXE9 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VN1R3Q9BXE9 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VN1R3Q9BXE9 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
VN1R3Q9BXE9 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VN1R3Q9BXE9 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VN1R3Q9BXE9 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VN1R3Q9BXE9 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
VN1R3Q9BXE9 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VN1R3Q9BXE9 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VN1R3Q9BXE9 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VN1R3Q9BXE9 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VN1R3Q9BXE9 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VN1R3Q9BXE9 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
VN1R3Q9BXE9 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VN1R3Q9BXE9 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VN1R3Q9BXE9 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VN1R3Q9BXE9 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
VN1R3Q9BXE9 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VN1R3Q9BXE9 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VN1R3Q9BXE9 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VN1R3Q9BXE9 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VN1R3Q9BXE9 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VN1R3Q9BXE9 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
VN1R3Q9BXE9 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VN1R3Q9BXE9 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VN1R3Q9BXE9 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VN1R3Q9BXE9 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VN1R3Q9BXE9 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
VN1R3Q9BXE9 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VN1R3Q9BXE9 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VN1R3Q9BXE9 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VN1R3Q9BXE9 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VN1R3Q9BXE9 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
VN1R3Q9BXE9 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VN1R3Q9BXE9 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VN1R3Q9BXE9 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VN1R3Q9BXE9 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms