Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXA9

SALL3, Sal-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL3Q9BXA9 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SALL3Q9BXA9 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SALL3Q9BXA9 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SALL3Q9BXA9 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SALL3Q9BXA9 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SALL3Q9BXA9 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SALL3Q9BXA9 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SALL3Q9BXA9 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
SALL3Q9BXA9 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SALL3Q9BXA9 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SALL3Q9BXA9 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SALL3Q9BXA9 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SALL3Q9BXA9 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SALL3Q9BXA9 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SALL3Q9BXA9 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SALL3Q9BXA9 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SALL3Q9BXA9 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SALL3Q9BXA9 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SALL3Q9BXA9 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SALL3Q9BXA9 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
SALL3Q9BXA9 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SALL3Q9BXA9 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
SALL3Q9BXA9 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SALL3Q9BXA9 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SALL3Q9BXA9 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
SALL3Q9BXA9 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SALL3Q9BXA9 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SALL3Q9BXA9 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SALL3Q9BXA9 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SALL3Q9BXA9 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SALL3Q9BXA9 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SALL3Q9BXA9 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SALL3Q9BXA9 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SALL3Q9BXA9 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SALL3Q9BXA9 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SALL3Q9BXA9 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SALL3Q9BXA9 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SALL3Q9BXA9 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SALL3Q9BXA9 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SALL3Q9BXA9 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SALL3Q9BXA9 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SALL3Q9BXA9 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SALL3Q9BXA9 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
SALL3Q9BXA9 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SALL3Q9BXA9 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SALL3Q9BXA9 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SALL3Q9BXA9 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SALL3Q9BXA9 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SALL3Q9BXA9 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SALL3Q9BXA9 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SALL3Q9BXA9 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SALL3Q9BXA9 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SALL3Q9BXA9 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SALL3Q9BXA9 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SALL3Q9BXA9 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SALL3Q9BXA9 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SALL3Q9BXA9 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SALL3Q9BXA9 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SALL3Q9BXA9 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SALL3Q9BXA9 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SALL3Q9BXA9 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SALL3Q9BXA9 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SALL3Q9BXA9 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SALL3Q9BXA9 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
SALL3Q9BXA9 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SALL3Q9BXA9 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SALL3Q9BXA9 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SALL3Q9BXA9 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SALL3Q9BXA9 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SALL3Q9BXA9 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
SALL3Q9BXA9 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SALL3Q9BXA9 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SALL3Q9BXA9 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
SALL3Q9BXA9 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SALL3Q9BXA9 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SALL3Q9BXA9 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SALL3Q9BXA9 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SALL3Q9BXA9 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SALL3Q9BXA9 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SALL3Q9BXA9 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SALL3Q9BXA9 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SALL3Q9BXA9 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SALL3Q9BXA9 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SALL3Q9BXA9 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SALL3Q9BXA9 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SALL3Q9BXA9 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SALL3Q9BXA9 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SALL3Q9BXA9 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SALL3Q9BXA9 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SALL3Q9BXA9 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SALL3Q9BXA9 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SALL3Q9BXA9 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SALL3Q9BXA9 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SALL3Q9BXA9 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
SALL3Q9BXA9 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SALL3Q9BXA9 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SALL3Q9BXA9 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SALL3Q9BXA9 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SALL3Q9BXA9 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SALL3Q9BXA9 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms