Protein–RNA interactions for Protein: Q99578

RIT2, GTP-binding protein Rit2, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIT2Q99578 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RIT2Q99578 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RIT2Q99578 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RIT2Q99578 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RIT2Q99578 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RIT2Q99578 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RIT2Q99578 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RIT2Q99578 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RIT2Q99578 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RIT2Q99578 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
RIT2Q99578 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RIT2Q99578 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RIT2Q99578 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
RIT2Q99578 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RIT2Q99578 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RIT2Q99578 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RIT2Q99578 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RIT2Q99578 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RIT2Q99578 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RIT2Q99578 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RIT2Q99578 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
RIT2Q99578 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RIT2Q99578 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RIT2Q99578 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RIT2Q99578 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RIT2Q99578 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RIT2Q99578 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RIT2Q99578 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RIT2Q99578 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
RIT2Q99578 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RIT2Q99578 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RIT2Q99578 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
RIT2Q99578 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RIT2Q99578 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RIT2Q99578 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RIT2Q99578 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RIT2Q99578 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RIT2Q99578 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RIT2Q99578 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RIT2Q99578 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RIT2Q99578 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RIT2Q99578 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RIT2Q99578 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RIT2Q99578 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RIT2Q99578 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RIT2Q99578 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RIT2Q99578 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RIT2Q99578 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RIT2Q99578 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RIT2Q99578 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RIT2Q99578 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RIT2Q99578 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RIT2Q99578 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
RIT2Q99578 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RIT2Q99578 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RIT2Q99578 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RIT2Q99578 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RIT2Q99578 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RIT2Q99578 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RIT2Q99578 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RIT2Q99578 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RIT2Q99578 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RIT2Q99578 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RIT2Q99578 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RIT2Q99578 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RIT2Q99578 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RIT2Q99578 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RIT2Q99578 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RIT2Q99578 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RIT2Q99578 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RIT2Q99578 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RIT2Q99578 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RIT2Q99578 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RIT2Q99578 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RIT2Q99578 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RIT2Q99578 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
RIT2Q99578 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RIT2Q99578 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RIT2Q99578 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RIT2Q99578 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RIT2Q99578 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RIT2Q99578 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RIT2Q99578 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RIT2Q99578 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RIT2Q99578 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RIT2Q99578 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RIT2Q99578 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RIT2Q99578 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RIT2Q99578 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RIT2Q99578 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RIT2Q99578 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RIT2Q99578 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RIT2Q99578 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RIT2Q99578 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RIT2Q99578 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RIT2Q99578 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RIT2Q99578 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RIT2Q99578 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RIT2Q99578 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RIT2Q99578 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms