Protein–RNA interactions for Protein: Q96RP9

GFM1, Elongation factor G, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 751 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFM1Q96RP9 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GFM1Q96RP9 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GFM1Q96RP9 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GFM1Q96RP9 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GFM1Q96RP9 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GFM1Q96RP9 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GFM1Q96RP9 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GFM1Q96RP9 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GFM1Q96RP9 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
GFM1Q96RP9 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GFM1Q96RP9 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
GFM1Q96RP9 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GFM1Q96RP9 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GFM1Q96RP9 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GFM1Q96RP9 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GFM1Q96RP9 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GFM1Q96RP9 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
GFM1Q96RP9 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GFM1Q96RP9 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GFM1Q96RP9 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
GFM1Q96RP9 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GFM1Q96RP9 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GFM1Q96RP9 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GFM1Q96RP9 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GFM1Q96RP9 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GFM1Q96RP9 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GFM1Q96RP9 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GFM1Q96RP9 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GFM1Q96RP9 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GFM1Q96RP9 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GFM1Q96RP9 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GFM1Q96RP9 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GFM1Q96RP9 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GFM1Q96RP9 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GFM1Q96RP9 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GFM1Q96RP9 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GFM1Q96RP9 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
GFM1Q96RP9 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GFM1Q96RP9 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GFM1Q96RP9 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
GFM1Q96RP9 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
GFM1Q96RP9 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GFM1Q96RP9 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GFM1Q96RP9 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GFM1Q96RP9 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GFM1Q96RP9 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GFM1Q96RP9 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GFM1Q96RP9 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GFM1Q96RP9 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GFM1Q96RP9 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GFM1Q96RP9 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GFM1Q96RP9 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
GFM1Q96RP9 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GFM1Q96RP9 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GFM1Q96RP9 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GFM1Q96RP9 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GFM1Q96RP9 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
GFM1Q96RP9 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GFM1Q96RP9 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GFM1Q96RP9 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GFM1Q96RP9 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GFM1Q96RP9 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GFM1Q96RP9 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
GFM1Q96RP9 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GFM1Q96RP9 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GFM1Q96RP9 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GFM1Q96RP9 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GFM1Q96RP9 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GFM1Q96RP9 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GFM1Q96RP9 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GFM1Q96RP9 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GFM1Q96RP9 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GFM1Q96RP9 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GFM1Q96RP9 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GFM1Q96RP9 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GFM1Q96RP9 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GFM1Q96RP9 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GFM1Q96RP9 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GFM1Q96RP9 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GFM1Q96RP9 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GFM1Q96RP9 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GFM1Q96RP9 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GFM1Q96RP9 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GFM1Q96RP9 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GFM1Q96RP9 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GFM1Q96RP9 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GFM1Q96RP9 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GFM1Q96RP9 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GFM1Q96RP9 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GFM1Q96RP9 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GFM1Q96RP9 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GFM1Q96RP9 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GFM1Q96RP9 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GFM1Q96RP9 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GFM1Q96RP9 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GFM1Q96RP9 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GFM1Q96RP9 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GFM1Q96RP9 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GFM1Q96RP9 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GFM1Q96RP9 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.1 ms