Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT4

SAMD8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD8Q96LT4 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SAMD8Q96LT4 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SAMD8Q96LT4 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SAMD8Q96LT4 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SAMD8Q96LT4 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SAMD8Q96LT4 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SAMD8Q96LT4 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SAMD8Q96LT4 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
SAMD8Q96LT4 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SAMD8Q96LT4 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SAMD8Q96LT4 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
SAMD8Q96LT4 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SAMD8Q96LT4 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SAMD8Q96LT4 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SAMD8Q96LT4 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
SAMD8Q96LT4 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
SAMD8Q96LT4 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
SAMD8Q96LT4 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
SAMD8Q96LT4 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
SAMD8Q96LT4 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC14.33□□□□□ -0.11
SAMD8Q96LT4 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
SAMD8Q96LT4 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
SAMD8Q96LT4 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
SAMD8Q96LT4 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
SAMD8Q96LT4 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SAMD8Q96LT4 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
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SAMD8Q96LT4 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SAMD8Q96LT4 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SAMD8Q96LT4 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SAMD8Q96LT4 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SAMD8Q96LT4 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SAMD8Q96LT4 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SAMD8Q96LT4 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SAMD8Q96LT4 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SAMD8Q96LT4 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SAMD8Q96LT4 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SAMD8Q96LT4 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SAMD8Q96LT4 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SAMD8Q96LT4 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SAMD8Q96LT4 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SAMD8Q96LT4 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
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SAMD8Q96LT4 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SAMD8Q96LT4 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
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SAMD8Q96LT4 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
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SAMD8Q96LT4 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SAMD8Q96LT4 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SAMD8Q96LT4 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SAMD8Q96LT4 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SAMD8Q96LT4 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SAMD8Q96LT4 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SAMD8Q96LT4 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SAMD8Q96LT4 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SAMD8Q96LT4 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SAMD8Q96LT4 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SAMD8Q96LT4 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SAMD8Q96LT4 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SAMD8Q96LT4 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
SAMD8Q96LT4 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SAMD8Q96LT4 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
SAMD8Q96LT4 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SAMD8Q96LT4 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SAMD8Q96LT4 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SAMD8Q96LT4 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SAMD8Q96LT4 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
SAMD8Q96LT4 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
SAMD8Q96LT4 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SAMD8Q96LT4 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SAMD8Q96LT4 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SAMD8Q96LT4 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
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