Protein–RNA interactions for Protein: Q96KX2

CAPZA3, F-actin-capping protein subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPZA3Q96KX2 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CAPZA3Q96KX2 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CAPZA3Q96KX2 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CAPZA3Q96KX2 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CAPZA3Q96KX2 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CAPZA3Q96KX2 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CAPZA3Q96KX2 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CAPZA3Q96KX2 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CAPZA3Q96KX2 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CAPZA3Q96KX2 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CAPZA3Q96KX2 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CAPZA3Q96KX2 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CAPZA3Q96KX2 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CAPZA3Q96KX2 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CAPZA3Q96KX2 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CAPZA3Q96KX2 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CAPZA3Q96KX2 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CAPZA3Q96KX2 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CAPZA3Q96KX2 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CAPZA3Q96KX2 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CAPZA3Q96KX2 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CAPZA3Q96KX2 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CAPZA3Q96KX2 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CAPZA3Q96KX2 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CAPZA3Q96KX2 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CAPZA3Q96KX2 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CAPZA3Q96KX2 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CAPZA3Q96KX2 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CAPZA3Q96KX2 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CAPZA3Q96KX2 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CAPZA3Q96KX2 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CAPZA3Q96KX2 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CAPZA3Q96KX2 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CAPZA3Q96KX2 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CAPZA3Q96KX2 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CAPZA3Q96KX2 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CAPZA3Q96KX2 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CAPZA3Q96KX2 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CAPZA3Q96KX2 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CAPZA3Q96KX2 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CAPZA3Q96KX2 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CAPZA3Q96KX2 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CAPZA3Q96KX2 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CAPZA3Q96KX2 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CAPZA3Q96KX2 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CAPZA3Q96KX2 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CAPZA3Q96KX2 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CAPZA3Q96KX2 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CAPZA3Q96KX2 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CAPZA3Q96KX2 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CAPZA3Q96KX2 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CAPZA3Q96KX2 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CAPZA3Q96KX2 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CAPZA3Q96KX2 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CAPZA3Q96KX2 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CAPZA3Q96KX2 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CAPZA3Q96KX2 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CAPZA3Q96KX2 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CAPZA3Q96KX2 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CAPZA3Q96KX2 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CAPZA3Q96KX2 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CAPZA3Q96KX2 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CAPZA3Q96KX2 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CAPZA3Q96KX2 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CAPZA3Q96KX2 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CAPZA3Q96KX2 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CAPZA3Q96KX2 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CAPZA3Q96KX2 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CAPZA3Q96KX2 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CAPZA3Q96KX2 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CAPZA3Q96KX2 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CAPZA3Q96KX2 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CAPZA3Q96KX2 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CAPZA3Q96KX2 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CAPZA3Q96KX2 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CAPZA3Q96KX2 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CAPZA3Q96KX2 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CAPZA3Q96KX2 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CAPZA3Q96KX2 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CAPZA3Q96KX2 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CAPZA3Q96KX2 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CAPZA3Q96KX2 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CAPZA3Q96KX2 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CAPZA3Q96KX2 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CAPZA3Q96KX2 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CAPZA3Q96KX2 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CAPZA3Q96KX2 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CAPZA3Q96KX2 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CAPZA3Q96KX2 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CAPZA3Q96KX2 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CAPZA3Q96KX2 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CAPZA3Q96KX2 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CAPZA3Q96KX2 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CAPZA3Q96KX2 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CAPZA3Q96KX2 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CAPZA3Q96KX2 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CAPZA3Q96KX2 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CAPZA3Q96KX2 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CAPZA3Q96KX2 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CAPZA3Q96KX2 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms