Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB2

COG3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG3Q96JB2 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
COG3Q96JB2 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
COG3Q96JB2 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
COG3Q96JB2 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
COG3Q96JB2 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
COG3Q96JB2 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
COG3Q96JB2 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
COG3Q96JB2 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
COG3Q96JB2 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
COG3Q96JB2 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
COG3Q96JB2 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
COG3Q96JB2 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
COG3Q96JB2 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
COG3Q96JB2 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
COG3Q96JB2 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
COG3Q96JB2 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
COG3Q96JB2 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
COG3Q96JB2 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
COG3Q96JB2 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
COG3Q96JB2 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
COG3Q96JB2 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.95
COG3Q96JB2 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
COG3Q96JB2 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
COG3Q96JB2 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
COG3Q96JB2 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
COG3Q96JB2 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
COG3Q96JB2 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
COG3Q96JB2 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
COG3Q96JB2 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
COG3Q96JB2 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
COG3Q96JB2 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
COG3Q96JB2 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
COG3Q96JB2 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
COG3Q96JB2 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
COG3Q96JB2 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
COG3Q96JB2 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
COG3Q96JB2 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
COG3Q96JB2 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
COG3Q96JB2 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
COG3Q96JB2 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
COG3Q96JB2 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
COG3Q96JB2 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
COG3Q96JB2 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
COG3Q96JB2 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
COG3Q96JB2 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
COG3Q96JB2 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
COG3Q96JB2 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
COG3Q96JB2 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
COG3Q96JB2 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
COG3Q96JB2 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
COG3Q96JB2 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
COG3Q96JB2 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
COG3Q96JB2 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
COG3Q96JB2 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
COG3Q96JB2 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
COG3Q96JB2 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
COG3Q96JB2 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
COG3Q96JB2 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
COG3Q96JB2 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
COG3Q96JB2 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
COG3Q96JB2 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
COG3Q96JB2 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
COG3Q96JB2 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
COG3Q96JB2 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
COG3Q96JB2 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
COG3Q96JB2 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
COG3Q96JB2 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
COG3Q96JB2 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
COG3Q96JB2 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
COG3Q96JB2 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
COG3Q96JB2 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
COG3Q96JB2 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
COG3Q96JB2 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
COG3Q96JB2 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
COG3Q96JB2 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
COG3Q96JB2 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
COG3Q96JB2 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
COG3Q96JB2 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
COG3Q96JB2 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
COG3Q96JB2 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
COG3Q96JB2 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
COG3Q96JB2 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
COG3Q96JB2 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
COG3Q96JB2 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
COG3Q96JB2 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
COG3Q96JB2 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
COG3Q96JB2 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
COG3Q96JB2 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
COG3Q96JB2 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
COG3Q96JB2 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
COG3Q96JB2 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
COG3Q96JB2 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
COG3Q96JB2 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
COG3Q96JB2 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
COG3Q96JB2 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
COG3Q96JB2 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
COG3Q96JB2 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
COG3Q96JB2 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC20.93■□□□□ 0.94
COG3Q96JB2 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
COG3Q96JB2 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms