Protein–RNA interactions for Protein: Q96EP1

CHFR, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, humanhuman

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Length 664 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHFRQ96EP1 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CHFRQ96EP1 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHFRQ96EP1 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHFRQ96EP1 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CHFRQ96EP1 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHFRQ96EP1 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHFRQ96EP1 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHFRQ96EP1 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHFRQ96EP1 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHFRQ96EP1 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHFRQ96EP1 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHFRQ96EP1 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHFRQ96EP1 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHFRQ96EP1 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHFRQ96EP1 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHFRQ96EP1 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHFRQ96EP1 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHFRQ96EP1 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CHFRQ96EP1 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHFRQ96EP1 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHFRQ96EP1 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHFRQ96EP1 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHFRQ96EP1 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHFRQ96EP1 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
CHFRQ96EP1 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHFRQ96EP1 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHFRQ96EP1 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHFRQ96EP1 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHFRQ96EP1 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHFRQ96EP1 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHFRQ96EP1 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHFRQ96EP1 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHFRQ96EP1 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHFRQ96EP1 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHFRQ96EP1 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHFRQ96EP1 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHFRQ96EP1 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CHFRQ96EP1 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHFRQ96EP1 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHFRQ96EP1 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHFRQ96EP1 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHFRQ96EP1 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHFRQ96EP1 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHFRQ96EP1 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHFRQ96EP1 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHFRQ96EP1 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CHFRQ96EP1 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHFRQ96EP1 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHFRQ96EP1 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CHFRQ96EP1 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CHFRQ96EP1 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CHFRQ96EP1 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CHFRQ96EP1 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHFRQ96EP1 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHFRQ96EP1 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHFRQ96EP1 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHFRQ96EP1 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHFRQ96EP1 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHFRQ96EP1 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHFRQ96EP1 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHFRQ96EP1 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHFRQ96EP1 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CHFRQ96EP1 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CHFRQ96EP1 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHFRQ96EP1 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHFRQ96EP1 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHFRQ96EP1 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHFRQ96EP1 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHFRQ96EP1 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHFRQ96EP1 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHFRQ96EP1 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHFRQ96EP1 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHFRQ96EP1 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHFRQ96EP1 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHFRQ96EP1 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHFRQ96EP1 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHFRQ96EP1 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CHFRQ96EP1 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHFRQ96EP1 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHFRQ96EP1 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHFRQ96EP1 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHFRQ96EP1 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHFRQ96EP1 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CHFRQ96EP1 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHFRQ96EP1 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHFRQ96EP1 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CHFRQ96EP1 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHFRQ96EP1 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHFRQ96EP1 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHFRQ96EP1 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHFRQ96EP1 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHFRQ96EP1 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHFRQ96EP1 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHFRQ96EP1 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHFRQ96EP1 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHFRQ96EP1 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHFRQ96EP1 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHFRQ96EP1 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHFRQ96EP1 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHFRQ96EP1 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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