Protein–RNA interactions for Protein: Q969G9

NKD1, Protein naked cuticle homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKD1Q969G9 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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NKD1Q969G9 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NKD1Q969G9 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NKD1Q969G9 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NKD1Q969G9 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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