Protein–RNA interactions for Protein: Q93008

USP9X, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-X, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,570 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP9XQ93008 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
USP9XQ93008 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
USP9XQ93008 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
USP9XQ93008 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
USP9XQ93008 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
USP9XQ93008 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.26
USP9XQ93008 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
USP9XQ93008 ALG1L13P-202ENST00000519320 584 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
USP9XQ93008 AC135983.1-201ENST00000562108 1097 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
USP9XQ93008 NPTN-204ENST00000562924 1094 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
USP9XQ93008 SNX11-210ENST00000582104 1282 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
USP9XQ93008 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
USP9XQ93008 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
USP9XQ93008 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
USP9XQ93008 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
USP9XQ93008 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
USP9XQ93008 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
USP9XQ93008 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.26
USP9XQ93008 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
USP9XQ93008 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
USP9XQ93008 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
USP9XQ93008 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
USP9XQ93008 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
USP9XQ93008 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
USP9XQ93008 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
USP9XQ93008 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
USP9XQ93008 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
USP9XQ93008 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
USP9XQ93008 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
USP9XQ93008 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
USP9XQ93008 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
USP9XQ93008 VEGFB-202ENST00000426086 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
USP9XQ93008 SOX9-AS1-207ENST00000446332 443 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
USP9XQ93008 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC13.45□□□□□ -0.26
USP9XQ93008 RN7SL67P-201ENST00000492147 296 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
USP9XQ93008 SIRT3-210ENST00000529382 1225 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
USP9XQ93008 AC012158.2-201ENST00000536546 354 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
USP9XQ93008 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
USP9XQ93008 RPL19-207ENST00000582193 792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
USP9XQ93008 AC020922.3-201ENST00000595064 547 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
USP9XQ93008 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
USP9XQ93008 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
USP9XQ93008 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
USP9XQ93008 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
USP9XQ93008 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
USP9XQ93008 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
USP9XQ93008 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
USP9XQ93008 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
USP9XQ93008 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
USP9XQ93008 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
USP9XQ93008 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
USP9XQ93008 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
USP9XQ93008 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
USP9XQ93008 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
USP9XQ93008 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
USP9XQ93008 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
USP9XQ93008 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
USP9XQ93008 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
USP9XQ93008 NCK1-AS1-203ENST00000474250 827 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
USP9XQ93008 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
USP9XQ93008 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
USP9XQ93008 TMBIM4-208ENST00000542724 770 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
USP9XQ93008 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
USP9XQ93008 REC114-202ENST00000560581 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
USP9XQ93008 NAT9-211ENST00000580632 799 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
USP9XQ93008 AC008687.1-201ENST00000591656 786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
USP9XQ93008 HPN-206ENST00000597419 1212 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
USP9XQ93008 AC006158.1-201ENST00000610661 249 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
USP9XQ93008 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
USP9XQ93008 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
USP9XQ93008 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
USP9XQ93008 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
USP9XQ93008 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
USP9XQ93008 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
USP9XQ93008 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
USP9XQ93008 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
USP9XQ93008 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
USP9XQ93008 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
USP9XQ93008 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
USP9XQ93008 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
USP9XQ93008 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
USP9XQ93008 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
USP9XQ93008 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
USP9XQ93008 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
USP9XQ93008 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
USP9XQ93008 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
USP9XQ93008 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
USP9XQ93008 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
USP9XQ93008 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
USP9XQ93008 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
USP9XQ93008 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
USP9XQ93008 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
USP9XQ93008 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
USP9XQ93008 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
USP9XQ93008 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
USP9XQ93008 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
USP9XQ93008 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
USP9XQ93008 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
USP9XQ93008 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
USP9XQ93008 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
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