Protein–RNA interactions for Protein: Q92854

SEMA4D, Semaphorin-4D, humanhuman

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Length 862 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4DQ92854 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SEMA4DQ92854 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SEMA4DQ92854 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SEMA4DQ92854 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SEMA4DQ92854 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SEMA4DQ92854 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SEMA4DQ92854 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SEMA4DQ92854 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SEMA4DQ92854 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SEMA4DQ92854 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SEMA4DQ92854 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SEMA4DQ92854 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SEMA4DQ92854 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SEMA4DQ92854 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SEMA4DQ92854 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
SEMA4DQ92854 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SEMA4DQ92854 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SEMA4DQ92854 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SEMA4DQ92854 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SEMA4DQ92854 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SEMA4DQ92854 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
SEMA4DQ92854 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SEMA4DQ92854 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
SEMA4DQ92854 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SEMA4DQ92854 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SEMA4DQ92854 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SEMA4DQ92854 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
SEMA4DQ92854 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SEMA4DQ92854 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SEMA4DQ92854 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SEMA4DQ92854 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SEMA4DQ92854 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SEMA4DQ92854 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SEMA4DQ92854 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
SEMA4DQ92854 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SEMA4DQ92854 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SEMA4DQ92854 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SEMA4DQ92854 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SEMA4DQ92854 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SEMA4DQ92854 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SEMA4DQ92854 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SEMA4DQ92854 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
SEMA4DQ92854 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SEMA4DQ92854 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SEMA4DQ92854 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SEMA4DQ92854 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SEMA4DQ92854 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SEMA4DQ92854 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SEMA4DQ92854 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SEMA4DQ92854 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SEMA4DQ92854 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SEMA4DQ92854 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SEMA4DQ92854 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SEMA4DQ92854 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SEMA4DQ92854 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SEMA4DQ92854 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SEMA4DQ92854 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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SEMA4DQ92854 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SEMA4DQ92854 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SEMA4DQ92854 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SEMA4DQ92854 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SEMA4DQ92854 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SEMA4DQ92854 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SEMA4DQ92854 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SEMA4DQ92854 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SEMA4DQ92854 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
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SEMA4DQ92854 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SEMA4DQ92854 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SEMA4DQ92854 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SEMA4DQ92854 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SEMA4DQ92854 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SEMA4DQ92854 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SEMA4DQ92854 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SEMA4DQ92854 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
SEMA4DQ92854 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SEMA4DQ92854 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SEMA4DQ92854 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
SEMA4DQ92854 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SEMA4DQ92854 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SEMA4DQ92854 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SEMA4DQ92854 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SEMA4DQ92854 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SEMA4DQ92854 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SEMA4DQ92854 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SEMA4DQ92854 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SEMA4DQ92854 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SEMA4DQ92854 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SEMA4DQ92854 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SEMA4DQ92854 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SEMA4DQ92854 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SEMA4DQ92854 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SEMA4DQ92854 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
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