Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
UBXN4Q92575 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
UBXN4Q92575 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
UBXN4Q92575 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
UBXN4Q92575 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
UBXN4Q92575 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
UBXN4Q92575 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
UBXN4Q92575 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
UBXN4Q92575 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
UBXN4Q92575 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
UBXN4Q92575 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
UBXN4Q92575 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
UBXN4Q92575 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
UBXN4Q92575 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
UBXN4Q92575 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
UBXN4Q92575 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
UBXN4Q92575 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
UBXN4Q92575 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
UBXN4Q92575 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
UBXN4Q92575 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
UBXN4Q92575 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
UBXN4Q92575 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
UBXN4Q92575 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
UBXN4Q92575 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
UBXN4Q92575 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
UBXN4Q92575 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
UBXN4Q92575 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
UBXN4Q92575 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
UBXN4Q92575 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
UBXN4Q92575 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
UBXN4Q92575 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
UBXN4Q92575 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
UBXN4Q92575 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
UBXN4Q92575 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
UBXN4Q92575 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
UBXN4Q92575 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
UBXN4Q92575 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
UBXN4Q92575 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
UBXN4Q92575 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
UBXN4Q92575 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
UBXN4Q92575 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
UBXN4Q92575 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
UBXN4Q92575 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
UBXN4Q92575 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
UBXN4Q92575 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
UBXN4Q92575 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
UBXN4Q92575 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
UBXN4Q92575 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
UBXN4Q92575 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
UBXN4Q92575 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
UBXN4Q92575 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
UBXN4Q92575 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
UBXN4Q92575 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
UBXN4Q92575 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
UBXN4Q92575 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
UBXN4Q92575 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
UBXN4Q92575 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
UBXN4Q92575 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
UBXN4Q92575 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
UBXN4Q92575 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
UBXN4Q92575 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
UBXN4Q92575 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
UBXN4Q92575 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
UBXN4Q92575 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
UBXN4Q92575 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
UBXN4Q92575 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
UBXN4Q92575 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
UBXN4Q92575 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
UBXN4Q92575 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
UBXN4Q92575 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
UBXN4Q92575 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
UBXN4Q92575 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
UBXN4Q92575 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
UBXN4Q92575 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
UBXN4Q92575 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
UBXN4Q92575 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
UBXN4Q92575 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
UBXN4Q92575 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
UBXN4Q92575 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
UBXN4Q92575 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
UBXN4Q92575 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
UBXN4Q92575 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
UBXN4Q92575 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
UBXN4Q92575 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
UBXN4Q92575 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
UBXN4Q92575 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
UBXN4Q92575 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
UBXN4Q92575 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
UBXN4Q92575 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
UBXN4Q92575 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
UBXN4Q92575 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
UBXN4Q92575 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
UBXN4Q92575 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
UBXN4Q92575 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
UBXN4Q92575 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
UBXN4Q92575 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
UBXN4Q92575 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
UBXN4Q92575 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
UBXN4Q92575 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
UBXN4Q92575 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms