Protein–RNA interactions for Protein: Q8WYN3

CSRNP3, Cysteine/serine-rich nuclear protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRNP3Q8WYN3 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CSRNP3Q8WYN3 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CSRNP3Q8WYN3 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
CSRNP3Q8WYN3 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CSRNP3Q8WYN3 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CSRNP3Q8WYN3 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CSRNP3Q8WYN3 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
CSRNP3Q8WYN3 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
CSRNP3Q8WYN3 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
CSRNP3Q8WYN3 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
CSRNP3Q8WYN3 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
CSRNP3Q8WYN3 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CSRNP3Q8WYN3 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CSRNP3Q8WYN3 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CSRNP3Q8WYN3 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CSRNP3Q8WYN3 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CSRNP3Q8WYN3 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CSRNP3Q8WYN3 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CSRNP3Q8WYN3 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CSRNP3Q8WYN3 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CSRNP3Q8WYN3 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CSRNP3Q8WYN3 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CSRNP3Q8WYN3 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CSRNP3Q8WYN3 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CSRNP3Q8WYN3 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CSRNP3Q8WYN3 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CSRNP3Q8WYN3 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CSRNP3Q8WYN3 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CSRNP3Q8WYN3 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CSRNP3Q8WYN3 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CSRNP3Q8WYN3 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CSRNP3Q8WYN3 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CSRNP3Q8WYN3 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CSRNP3Q8WYN3 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CSRNP3Q8WYN3 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CSRNP3Q8WYN3 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CSRNP3Q8WYN3 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CSRNP3Q8WYN3 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CSRNP3Q8WYN3 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CSRNP3Q8WYN3 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CSRNP3Q8WYN3 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CSRNP3Q8WYN3 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CSRNP3Q8WYN3 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CSRNP3Q8WYN3 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CSRNP3Q8WYN3 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CSRNP3Q8WYN3 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CSRNP3Q8WYN3 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CSRNP3Q8WYN3 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CSRNP3Q8WYN3 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CSRNP3Q8WYN3 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CSRNP3Q8WYN3 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CSRNP3Q8WYN3 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CSRNP3Q8WYN3 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CSRNP3Q8WYN3 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CSRNP3Q8WYN3 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CSRNP3Q8WYN3 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CSRNP3Q8WYN3 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CSRNP3Q8WYN3 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CSRNP3Q8WYN3 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CSRNP3Q8WYN3 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CSRNP3Q8WYN3 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CSRNP3Q8WYN3 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CSRNP3Q8WYN3 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CSRNP3Q8WYN3 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CSRNP3Q8WYN3 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CSRNP3Q8WYN3 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CSRNP3Q8WYN3 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CSRNP3Q8WYN3 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CSRNP3Q8WYN3 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CSRNP3Q8WYN3 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CSRNP3Q8WYN3 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CSRNP3Q8WYN3 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CSRNP3Q8WYN3 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CSRNP3Q8WYN3 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CSRNP3Q8WYN3 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CSRNP3Q8WYN3 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CSRNP3Q8WYN3 AC008686.1-203ENST00000591826 463 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CSRNP3Q8WYN3 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CSRNP3Q8WYN3 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CSRNP3Q8WYN3 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CSRNP3Q8WYN3 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CSRNP3Q8WYN3 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CSRNP3Q8WYN3 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CSRNP3Q8WYN3 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CSRNP3Q8WYN3 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CSRNP3Q8WYN3 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CSRNP3Q8WYN3 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CSRNP3Q8WYN3 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CSRNP3Q8WYN3 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CSRNP3Q8WYN3 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CSRNP3Q8WYN3 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CSRNP3Q8WYN3 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CSRNP3Q8WYN3 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CSRNP3Q8WYN3 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CSRNP3Q8WYN3 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CSRNP3Q8WYN3 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CSRNP3Q8WYN3 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CSRNP3Q8WYN3 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CSRNP3Q8WYN3 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CSRNP3Q8WYN3 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms