Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEV1

CSNK2A3, Casein kinase II subunit alpha 3, humanhuman

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Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2A3Q8NEV1 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CSNK2A3Q8NEV1 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CSNK2A3Q8NEV1 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CSNK2A3Q8NEV1 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CSNK2A3Q8NEV1 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CSNK2A3Q8NEV1 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CSNK2A3Q8NEV1 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CSNK2A3Q8NEV1 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CSNK2A3Q8NEV1 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
CSNK2A3Q8NEV1 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CSNK2A3Q8NEV1 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
CSNK2A3Q8NEV1 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
CSNK2A3Q8NEV1 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
CSNK2A3Q8NEV1 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CSNK2A3Q8NEV1 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CSNK2A3Q8NEV1 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CSNK2A3Q8NEV1 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CSNK2A3Q8NEV1 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CSNK2A3Q8NEV1 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CSNK2A3Q8NEV1 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CSNK2A3Q8NEV1 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CSNK2A3Q8NEV1 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CSNK2A3Q8NEV1 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
CSNK2A3Q8NEV1 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CSNK2A3Q8NEV1 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CSNK2A3Q8NEV1 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CSNK2A3Q8NEV1 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CSNK2A3Q8NEV1 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CSNK2A3Q8NEV1 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CSNK2A3Q8NEV1 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
CSNK2A3Q8NEV1 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
CSNK2A3Q8NEV1 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CSNK2A3Q8NEV1 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CSNK2A3Q8NEV1 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CSNK2A3Q8NEV1 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
CSNK2A3Q8NEV1 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
CSNK2A3Q8NEV1 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CSNK2A3Q8NEV1 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CSNK2A3Q8NEV1 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CSNK2A3Q8NEV1 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CSNK2A3Q8NEV1 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CSNK2A3Q8NEV1 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CSNK2A3Q8NEV1 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CSNK2A3Q8NEV1 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CSNK2A3Q8NEV1 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CSNK2A3Q8NEV1 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CSNK2A3Q8NEV1 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CSNK2A3Q8NEV1 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CSNK2A3Q8NEV1 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CSNK2A3Q8NEV1 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CSNK2A3Q8NEV1 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CSNK2A3Q8NEV1 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CSNK2A3Q8NEV1 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CSNK2A3Q8NEV1 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CSNK2A3Q8NEV1 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CSNK2A3Q8NEV1 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
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CSNK2A3Q8NEV1 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CSNK2A3Q8NEV1 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CSNK2A3Q8NEV1 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CSNK2A3Q8NEV1 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CSNK2A3Q8NEV1 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CSNK2A3Q8NEV1 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CSNK2A3Q8NEV1 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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CSNK2A3Q8NEV1 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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CSNK2A3Q8NEV1 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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CSNK2A3Q8NEV1 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
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CSNK2A3Q8NEV1 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CSNK2A3Q8NEV1 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CSNK2A3Q8NEV1 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CSNK2A3Q8NEV1 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CSNK2A3Q8NEV1 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CSNK2A3Q8NEV1 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CSNK2A3Q8NEV1 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CSNK2A3Q8NEV1 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
CSNK2A3Q8NEV1 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
CSNK2A3Q8NEV1 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CSNK2A3Q8NEV1 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CSNK2A3Q8NEV1 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
CSNK2A3Q8NEV1 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CSNK2A3Q8NEV1 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CSNK2A3Q8NEV1 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CSNK2A3Q8NEV1 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CSNK2A3Q8NEV1 PRKY-203ENST00000528056 7218 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CSNK2A3Q8NEV1 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CSNK2A3Q8NEV1 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CSNK2A3Q8NEV1 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CSNK2A3Q8NEV1 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CSNK2A3Q8NEV1 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CSNK2A3Q8NEV1 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CSNK2A3Q8NEV1 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CSNK2A3Q8NEV1 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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