Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK8

FAM46D, Putative nucleotidyltransferase FAM46D, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM46DQ8NEK8 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM46DQ8NEK8 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM46DQ8NEK8 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM46DQ8NEK8 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM46DQ8NEK8 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM46DQ8NEK8 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM46DQ8NEK8 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM46DQ8NEK8 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM46DQ8NEK8 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM46DQ8NEK8 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM46DQ8NEK8 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM46DQ8NEK8 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM46DQ8NEK8 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM46DQ8NEK8 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM46DQ8NEK8 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM46DQ8NEK8 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM46DQ8NEK8 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM46DQ8NEK8 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM46DQ8NEK8 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM46DQ8NEK8 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM46DQ8NEK8 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM46DQ8NEK8 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
FAM46DQ8NEK8 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
FAM46DQ8NEK8 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
FAM46DQ8NEK8 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
FAM46DQ8NEK8 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
FAM46DQ8NEK8 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
FAM46DQ8NEK8 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
FAM46DQ8NEK8 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM46DQ8NEK8 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM46DQ8NEK8 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM46DQ8NEK8 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM46DQ8NEK8 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM46DQ8NEK8 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM46DQ8NEK8 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM46DQ8NEK8 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM46DQ8NEK8 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM46DQ8NEK8 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM46DQ8NEK8 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM46DQ8NEK8 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM46DQ8NEK8 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM46DQ8NEK8 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM46DQ8NEK8 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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FAM46DQ8NEK8 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM46DQ8NEK8 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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FAM46DQ8NEK8 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM46DQ8NEK8 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM46DQ8NEK8 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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FAM46DQ8NEK8 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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FAM46DQ8NEK8 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM46DQ8NEK8 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM46DQ8NEK8 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM46DQ8NEK8 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM46DQ8NEK8 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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FAM46DQ8NEK8 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM46DQ8NEK8 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM46DQ8NEK8 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM46DQ8NEK8 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM46DQ8NEK8 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM46DQ8NEK8 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
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FAM46DQ8NEK8 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM46DQ8NEK8 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM46DQ8NEK8 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM46DQ8NEK8 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM46DQ8NEK8 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM46DQ8NEK8 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM46DQ8NEK8 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM46DQ8NEK8 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM46DQ8NEK8 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM46DQ8NEK8 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM46DQ8NEK8 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM46DQ8NEK8 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM46DQ8NEK8 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM46DQ8NEK8 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM46DQ8NEK8 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM46DQ8NEK8 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM46DQ8NEK8 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM46DQ8NEK8 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM46DQ8NEK8 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM46DQ8NEK8 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM46DQ8NEK8 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM46DQ8NEK8 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM46DQ8NEK8 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM46DQ8NEK8 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
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