Protein–RNA interactions for Protein: Q8N8U3

RTL3, Retrotransposon Gag-like protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL3Q8N8U3 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RTL3Q8N8U3 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RTL3Q8N8U3 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RTL3Q8N8U3 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RTL3Q8N8U3 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RTL3Q8N8U3 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RTL3Q8N8U3 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RTL3Q8N8U3 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RTL3Q8N8U3 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RTL3Q8N8U3 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RTL3Q8N8U3 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RTL3Q8N8U3 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RTL3Q8N8U3 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RTL3Q8N8U3 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RTL3Q8N8U3 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RTL3Q8N8U3 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RTL3Q8N8U3 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RTL3Q8N8U3 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RTL3Q8N8U3 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RTL3Q8N8U3 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RTL3Q8N8U3 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RTL3Q8N8U3 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RTL3Q8N8U3 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RTL3Q8N8U3 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RTL3Q8N8U3 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RTL3Q8N8U3 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RTL3Q8N8U3 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RTL3Q8N8U3 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RTL3Q8N8U3 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RTL3Q8N8U3 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RTL3Q8N8U3 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RTL3Q8N8U3 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RTL3Q8N8U3 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RTL3Q8N8U3 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RTL3Q8N8U3 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RTL3Q8N8U3 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RTL3Q8N8U3 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RTL3Q8N8U3 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RTL3Q8N8U3 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RTL3Q8N8U3 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RTL3Q8N8U3 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RTL3Q8N8U3 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RTL3Q8N8U3 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RTL3Q8N8U3 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RTL3Q8N8U3 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RTL3Q8N8U3 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RTL3Q8N8U3 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RTL3Q8N8U3 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RTL3Q8N8U3 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RTL3Q8N8U3 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RTL3Q8N8U3 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RTL3Q8N8U3 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
RTL3Q8N8U3 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RTL3Q8N8U3 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RTL3Q8N8U3 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RTL3Q8N8U3 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RTL3Q8N8U3 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RTL3Q8N8U3 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RTL3Q8N8U3 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RTL3Q8N8U3 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RTL3Q8N8U3 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RTL3Q8N8U3 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RTL3Q8N8U3 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RTL3Q8N8U3 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RTL3Q8N8U3 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RTL3Q8N8U3 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RTL3Q8N8U3 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RTL3Q8N8U3 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RTL3Q8N8U3 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RTL3Q8N8U3 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RTL3Q8N8U3 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RTL3Q8N8U3 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RTL3Q8N8U3 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RTL3Q8N8U3 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RTL3Q8N8U3 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RTL3Q8N8U3 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RTL3Q8N8U3 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RTL3Q8N8U3 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RTL3Q8N8U3 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RTL3Q8N8U3 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RTL3Q8N8U3 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RTL3Q8N8U3 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RTL3Q8N8U3 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RTL3Q8N8U3 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RTL3Q8N8U3 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RTL3Q8N8U3 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RTL3Q8N8U3 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RTL3Q8N8U3 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RTL3Q8N8U3 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RTL3Q8N8U3 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RTL3Q8N8U3 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RTL3Q8N8U3 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RTL3Q8N8U3 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RTL3Q8N8U3 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RTL3Q8N8U3 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RTL3Q8N8U3 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RTL3Q8N8U3 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RTL3Q8N8U3 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RTL3Q8N8U3 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RTL3Q8N8U3 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms