Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6F1

CLDN19, Claudin-19, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN19Q8N6F1 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
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CLDN19Q8N6F1 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLDN19Q8N6F1 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
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CLDN19Q8N6F1 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLDN19Q8N6F1 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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CLDN19Q8N6F1 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLDN19Q8N6F1 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLDN19Q8N6F1 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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CLDN19Q8N6F1 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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CLDN19Q8N6F1 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLDN19Q8N6F1 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLDN19Q8N6F1 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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CLDN19Q8N6F1 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLDN19Q8N6F1 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLDN19Q8N6F1 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
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CLDN19Q8N6F1 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLDN19Q8N6F1 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLDN19Q8N6F1 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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CLDN19Q8N6F1 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLDN19Q8N6F1 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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CLDN19Q8N6F1 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLDN19Q8N6F1 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLDN19Q8N6F1 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
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CLDN19Q8N6F1 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CLDN19Q8N6F1 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLDN19Q8N6F1 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLDN19Q8N6F1 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLDN19Q8N6F1 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLDN19Q8N6F1 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLDN19Q8N6F1 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLDN19Q8N6F1 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLDN19Q8N6F1 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLDN19Q8N6F1 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLDN19Q8N6F1 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLDN19Q8N6F1 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLDN19Q8N6F1 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLDN19Q8N6F1 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLDN19Q8N6F1 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLDN19Q8N6F1 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLDN19Q8N6F1 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
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