Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW0

LMNTD2, Lamin tail domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNTD2Q8IXW0 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LMNTD2Q8IXW0 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LMNTD2Q8IXW0 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LMNTD2Q8IXW0 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LMNTD2Q8IXW0 CRYBG1-204ENST00000633556 9909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LMNTD2Q8IXW0 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LMNTD2Q8IXW0 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LMNTD2Q8IXW0 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LMNTD2Q8IXW0 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LMNTD2Q8IXW0 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LMNTD2Q8IXW0 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LMNTD2Q8IXW0 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LMNTD2Q8IXW0 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LMNTD2Q8IXW0 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LMNTD2Q8IXW0 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LMNTD2Q8IXW0 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LMNTD2Q8IXW0 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LMNTD2Q8IXW0 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LMNTD2Q8IXW0 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
LMNTD2Q8IXW0 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
LMNTD2Q8IXW0 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LMNTD2Q8IXW0 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LMNTD2Q8IXW0 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LMNTD2Q8IXW0 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
LMNTD2Q8IXW0 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LMNTD2Q8IXW0 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LMNTD2Q8IXW0 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
LMNTD2Q8IXW0 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LMNTD2Q8IXW0 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
LMNTD2Q8IXW0 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LMNTD2Q8IXW0 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LMNTD2Q8IXW0 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LMNTD2Q8IXW0 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LMNTD2Q8IXW0 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LMNTD2Q8IXW0 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
LMNTD2Q8IXW0 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LMNTD2Q8IXW0 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LMNTD2Q8IXW0 TET2-207ENST00000513237 10166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LMNTD2Q8IXW0 TET2-209ENST00000540549 10166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LMNTD2Q8IXW0 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LMNTD2Q8IXW0 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LMNTD2Q8IXW0 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LMNTD2Q8IXW0 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LMNTD2Q8IXW0 AGAP1-201ENST00000304032 10832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LMNTD2Q8IXW0 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LMNTD2Q8IXW0 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LMNTD2Q8IXW0 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LMNTD2Q8IXW0 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LMNTD2Q8IXW0 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LMNTD2Q8IXW0 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LMNTD2Q8IXW0 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LMNTD2Q8IXW0 GRAMD4-202ENST00000406902 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LMNTD2Q8IXW0 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
LMNTD2Q8IXW0 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LMNTD2Q8IXW0 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LMNTD2Q8IXW0 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LMNTD2Q8IXW0 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LMNTD2Q8IXW0 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LMNTD2Q8IXW0 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LMNTD2Q8IXW0 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LMNTD2Q8IXW0 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LMNTD2Q8IXW0 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LMNTD2Q8IXW0 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LMNTD2Q8IXW0 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LMNTD2Q8IXW0 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LMNTD2Q8IXW0 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LMNTD2Q8IXW0 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
LMNTD2Q8IXW0 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
LMNTD2Q8IXW0 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
LMNTD2Q8IXW0 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LMNTD2Q8IXW0 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LMNTD2Q8IXW0 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LMNTD2Q8IXW0 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LMNTD2Q8IXW0 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
LMNTD2Q8IXW0 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LMNTD2Q8IXW0 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LMNTD2Q8IXW0 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LMNTD2Q8IXW0 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LMNTD2Q8IXW0 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LMNTD2Q8IXW0 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LMNTD2Q8IXW0 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LMNTD2Q8IXW0 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LMNTD2Q8IXW0 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LMNTD2Q8IXW0 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LMNTD2Q8IXW0 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LMNTD2Q8IXW0 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LMNTD2Q8IXW0 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LMNTD2Q8IXW0 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LMNTD2Q8IXW0 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LMNTD2Q8IXW0 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LMNTD2Q8IXW0 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LMNTD2Q8IXW0 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LMNTD2Q8IXW0 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LMNTD2Q8IXW0 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LMNTD2Q8IXW0 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LMNTD2Q8IXW0 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LMNTD2Q8IXW0 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LMNTD2Q8IXW0 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LMNTD2Q8IXW0 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
LMNTD2Q8IXW0 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms