Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWZ4

TRIM48, Tripartite motif-containing protein 48, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM48Q8IWZ4 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM48Q8IWZ4 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM48Q8IWZ4 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM48Q8IWZ4 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM48Q8IWZ4 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM48Q8IWZ4 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM48Q8IWZ4 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM48Q8IWZ4 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM48Q8IWZ4 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM48Q8IWZ4 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM48Q8IWZ4 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM48Q8IWZ4 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM48Q8IWZ4 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM48Q8IWZ4 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM48Q8IWZ4 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM48Q8IWZ4 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM48Q8IWZ4 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM48Q8IWZ4 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM48Q8IWZ4 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM48Q8IWZ4 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM48Q8IWZ4 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM48Q8IWZ4 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM48Q8IWZ4 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM48Q8IWZ4 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM48Q8IWZ4 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM48Q8IWZ4 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM48Q8IWZ4 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM48Q8IWZ4 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM48Q8IWZ4 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM48Q8IWZ4 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM48Q8IWZ4 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM48Q8IWZ4 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM48Q8IWZ4 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM48Q8IWZ4 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM48Q8IWZ4 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM48Q8IWZ4 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM48Q8IWZ4 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM48Q8IWZ4 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM48Q8IWZ4 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM48Q8IWZ4 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM48Q8IWZ4 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM48Q8IWZ4 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM48Q8IWZ4 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM48Q8IWZ4 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM48Q8IWZ4 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM48Q8IWZ4 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM48Q8IWZ4 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM48Q8IWZ4 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM48Q8IWZ4 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM48Q8IWZ4 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM48Q8IWZ4 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM48Q8IWZ4 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM48Q8IWZ4 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM48Q8IWZ4 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM48Q8IWZ4 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM48Q8IWZ4 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM48Q8IWZ4 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM48Q8IWZ4 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM48Q8IWZ4 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM48Q8IWZ4 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM48Q8IWZ4 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM48Q8IWZ4 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM48Q8IWZ4 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM48Q8IWZ4 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM48Q8IWZ4 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM48Q8IWZ4 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM48Q8IWZ4 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM48Q8IWZ4 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM48Q8IWZ4 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM48Q8IWZ4 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM48Q8IWZ4 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM48Q8IWZ4 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM48Q8IWZ4 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM48Q8IWZ4 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM48Q8IWZ4 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM48Q8IWZ4 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM48Q8IWZ4 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM48Q8IWZ4 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM48Q8IWZ4 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM48Q8IWZ4 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM48Q8IWZ4 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM48Q8IWZ4 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM48Q8IWZ4 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM48Q8IWZ4 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM48Q8IWZ4 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM48Q8IWZ4 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM48Q8IWZ4 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM48Q8IWZ4 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM48Q8IWZ4 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM48Q8IWZ4 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM48Q8IWZ4 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM48Q8IWZ4 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM48Q8IWZ4 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM48Q8IWZ4 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM48Q8IWZ4 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM48Q8IWZ4 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM48Q8IWZ4 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM48Q8IWZ4 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM48Q8IWZ4 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM48Q8IWZ4 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms