Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVW4

CDKL3, Cyclin-dependent kinase-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL3Q8IVW4 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDKL3Q8IVW4 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDKL3Q8IVW4 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDKL3Q8IVW4 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDKL3Q8IVW4 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDKL3Q8IVW4 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDKL3Q8IVW4 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDKL3Q8IVW4 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDKL3Q8IVW4 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDKL3Q8IVW4 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDKL3Q8IVW4 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDKL3Q8IVW4 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDKL3Q8IVW4 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDKL3Q8IVW4 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDKL3Q8IVW4 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDKL3Q8IVW4 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDKL3Q8IVW4 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDKL3Q8IVW4 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDKL3Q8IVW4 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDKL3Q8IVW4 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDKL3Q8IVW4 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDKL3Q8IVW4 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDKL3Q8IVW4 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDKL3Q8IVW4 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDKL3Q8IVW4 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDKL3Q8IVW4 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDKL3Q8IVW4 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDKL3Q8IVW4 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDKL3Q8IVW4 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDKL3Q8IVW4 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDKL3Q8IVW4 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDKL3Q8IVW4 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDKL3Q8IVW4 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDKL3Q8IVW4 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDKL3Q8IVW4 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDKL3Q8IVW4 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDKL3Q8IVW4 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDKL3Q8IVW4 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDKL3Q8IVW4 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CDKL3Q8IVW4 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDKL3Q8IVW4 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDKL3Q8IVW4 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDKL3Q8IVW4 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDKL3Q8IVW4 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDKL3Q8IVW4 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDKL3Q8IVW4 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDKL3Q8IVW4 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDKL3Q8IVW4 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDKL3Q8IVW4 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDKL3Q8IVW4 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDKL3Q8IVW4 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDKL3Q8IVW4 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDKL3Q8IVW4 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDKL3Q8IVW4 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDKL3Q8IVW4 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDKL3Q8IVW4 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDKL3Q8IVW4 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDKL3Q8IVW4 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDKL3Q8IVW4 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDKL3Q8IVW4 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDKL3Q8IVW4 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDKL3Q8IVW4 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDKL3Q8IVW4 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDKL3Q8IVW4 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDKL3Q8IVW4 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDKL3Q8IVW4 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDKL3Q8IVW4 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CDKL3Q8IVW4 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDKL3Q8IVW4 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CDKL3Q8IVW4 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDKL3Q8IVW4 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDKL3Q8IVW4 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDKL3Q8IVW4 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDKL3Q8IVW4 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDKL3Q8IVW4 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDKL3Q8IVW4 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDKL3Q8IVW4 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDKL3Q8IVW4 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDKL3Q8IVW4 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDKL3Q8IVW4 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CDKL3Q8IVW4 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDKL3Q8IVW4 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CDKL3Q8IVW4 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDKL3Q8IVW4 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDKL3Q8IVW4 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDKL3Q8IVW4 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDKL3Q8IVW4 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDKL3Q8IVW4 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDKL3Q8IVW4 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDKL3Q8IVW4 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDKL3Q8IVW4 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDKL3Q8IVW4 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDKL3Q8IVW4 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDKL3Q8IVW4 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDKL3Q8IVW4 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDKL3Q8IVW4 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDKL3Q8IVW4 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDKL3Q8IVW4 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDKL3Q8IVW4 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDKL3Q8IVW4 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms