Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z5U6

WDR53, WD repeat-containing protein 53, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR53Q7Z5U6 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
WDR53Q7Z5U6 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
WDR53Q7Z5U6 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
WDR53Q7Z5U6 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
WDR53Q7Z5U6 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
WDR53Q7Z5U6 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
WDR53Q7Z5U6 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
WDR53Q7Z5U6 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
WDR53Q7Z5U6 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
WDR53Q7Z5U6 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
WDR53Q7Z5U6 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
WDR53Q7Z5U6 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
WDR53Q7Z5U6 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
WDR53Q7Z5U6 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
WDR53Q7Z5U6 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
WDR53Q7Z5U6 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
WDR53Q7Z5U6 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
WDR53Q7Z5U6 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
WDR53Q7Z5U6 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC14.85□□□□□ -0.03
WDR53Q7Z5U6 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
WDR53Q7Z5U6 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
WDR53Q7Z5U6 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
WDR53Q7Z5U6 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
WDR53Q7Z5U6 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
WDR53Q7Z5U6 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
WDR53Q7Z5U6 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
WDR53Q7Z5U6 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
WDR53Q7Z5U6 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
WDR53Q7Z5U6 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
WDR53Q7Z5U6 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
WDR53Q7Z5U6 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
WDR53Q7Z5U6 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
WDR53Q7Z5U6 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
WDR53Q7Z5U6 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
WDR53Q7Z5U6 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
WDR53Q7Z5U6 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
WDR53Q7Z5U6 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
WDR53Q7Z5U6 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
WDR53Q7Z5U6 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
WDR53Q7Z5U6 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
WDR53Q7Z5U6 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
WDR53Q7Z5U6 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
WDR53Q7Z5U6 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
WDR53Q7Z5U6 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
WDR53Q7Z5U6 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
WDR53Q7Z5U6 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
WDR53Q7Z5U6 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
WDR53Q7Z5U6 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
WDR53Q7Z5U6 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
WDR53Q7Z5U6 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
WDR53Q7Z5U6 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
WDR53Q7Z5U6 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
WDR53Q7Z5U6 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
WDR53Q7Z5U6 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
WDR53Q7Z5U6 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
WDR53Q7Z5U6 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
WDR53Q7Z5U6 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
WDR53Q7Z5U6 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
WDR53Q7Z5U6 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
WDR53Q7Z5U6 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
WDR53Q7Z5U6 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
WDR53Q7Z5U6 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
WDR53Q7Z5U6 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
WDR53Q7Z5U6 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
WDR53Q7Z5U6 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
WDR53Q7Z5U6 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
WDR53Q7Z5U6 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
WDR53Q7Z5U6 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
WDR53Q7Z5U6 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
WDR53Q7Z5U6 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
WDR53Q7Z5U6 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
WDR53Q7Z5U6 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
WDR53Q7Z5U6 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.84□□□□□ -0.03
WDR53Q7Z5U6 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
WDR53Q7Z5U6 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC14.84□□□□□ -0.03
WDR53Q7Z5U6 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
WDR53Q7Z5U6 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
WDR53Q7Z5U6 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC14.84□□□□□ -0.03
WDR53Q7Z5U6 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
WDR53Q7Z5U6 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
WDR53Q7Z5U6 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
WDR53Q7Z5U6 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
WDR53Q7Z5U6 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
WDR53Q7Z5U6 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
WDR53Q7Z5U6 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
WDR53Q7Z5U6 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
WDR53Q7Z5U6 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
WDR53Q7Z5U6 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
WDR53Q7Z5U6 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
WDR53Q7Z5U6 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
WDR53Q7Z5U6 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
WDR53Q7Z5U6 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
WDR53Q7Z5U6 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
WDR53Q7Z5U6 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
WDR53Q7Z5U6 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.03
WDR53Q7Z5U6 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
WDR53Q7Z5U6 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
WDR53Q7Z5U6 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
WDR53Q7Z5U6 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
WDR53Q7Z5U6 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms