Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXM1

LRIG3, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG3Q6UXM1 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRIG3Q6UXM1 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRIG3Q6UXM1 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRIG3Q6UXM1 AC016876.1-201ENST00000415124 352 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRIG3Q6UXM1 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
LRIG3Q6UXM1 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
LRIG3Q6UXM1 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRIG3Q6UXM1 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRIG3Q6UXM1 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRIG3Q6UXM1 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
LRIG3Q6UXM1 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRIG3Q6UXM1 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRIG3Q6UXM1 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
LRIG3Q6UXM1 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRIG3Q6UXM1 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRIG3Q6UXM1 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRIG3Q6UXM1 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRIG3Q6UXM1 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRIG3Q6UXM1 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRIG3Q6UXM1 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRIG3Q6UXM1 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRIG3Q6UXM1 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRIG3Q6UXM1 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
LRIG3Q6UXM1 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
LRIG3Q6UXM1 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRIG3Q6UXM1 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRIG3Q6UXM1 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRIG3Q6UXM1 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRIG3Q6UXM1 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRIG3Q6UXM1 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRIG3Q6UXM1 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRIG3Q6UXM1 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LRIG3Q6UXM1 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LRIG3Q6UXM1 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LRIG3Q6UXM1 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LRIG3Q6UXM1 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LRIG3Q6UXM1 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LRIG3Q6UXM1 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LRIG3Q6UXM1 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LRIG3Q6UXM1 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LRIG3Q6UXM1 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LRIG3Q6UXM1 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LRIG3Q6UXM1 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LRIG3Q6UXM1 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LRIG3Q6UXM1 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LRIG3Q6UXM1 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LRIG3Q6UXM1 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LRIG3Q6UXM1 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LRIG3Q6UXM1 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LRIG3Q6UXM1 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LRIG3Q6UXM1 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LRIG3Q6UXM1 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LRIG3Q6UXM1 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LRIG3Q6UXM1 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LRIG3Q6UXM1 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LRIG3Q6UXM1 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LRIG3Q6UXM1 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LRIG3Q6UXM1 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LRIG3Q6UXM1 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
LRIG3Q6UXM1 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
LRIG3Q6UXM1 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LRIG3Q6UXM1 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LRIG3Q6UXM1 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LRIG3Q6UXM1 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LRIG3Q6UXM1 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LRIG3Q6UXM1 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LRIG3Q6UXM1 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LRIG3Q6UXM1 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LRIG3Q6UXM1 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LRIG3Q6UXM1 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LRIG3Q6UXM1 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LRIG3Q6UXM1 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LRIG3Q6UXM1 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LRIG3Q6UXM1 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LRIG3Q6UXM1 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LRIG3Q6UXM1 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LRIG3Q6UXM1 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LRIG3Q6UXM1 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LRIG3Q6UXM1 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LRIG3Q6UXM1 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LRIG3Q6UXM1 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LRIG3Q6UXM1 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LRIG3Q6UXM1 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LRIG3Q6UXM1 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LRIG3Q6UXM1 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LRIG3Q6UXM1 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LRIG3Q6UXM1 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LRIG3Q6UXM1 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LRIG3Q6UXM1 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LRIG3Q6UXM1 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LRIG3Q6UXM1 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LRIG3Q6UXM1 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LRIG3Q6UXM1 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LRIG3Q6UXM1 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LRIG3Q6UXM1 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LRIG3Q6UXM1 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LRIG3Q6UXM1 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
LRIG3Q6UXM1 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LRIG3Q6UXM1 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LRIG3Q6UXM1 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms