Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXD1

HRCT1, Histidine-rich carboxyl terminus protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HRCT1Q6UXD1 CHD5-201ENST00000262450 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
HRCT1Q6UXD1 MMAB-210ENST00000545712 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
HRCT1Q6UXD1 KCNH4-201ENST00000264661 3920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
HRCT1Q6UXD1 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
HRCT1Q6UXD1 TMPRSS13-202ENST00000445164 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
HRCT1Q6UXD1 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
HRCT1Q6UXD1 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
HRCT1Q6UXD1 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC9.97□□□□□ -0.81
HRCT1Q6UXD1 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
HRCT1Q6UXD1 NTSR1-201ENST00000370501 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
HRCT1Q6UXD1 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.97□□□□□ -0.81
HRCT1Q6UXD1 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
HRCT1Q6UXD1 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
HRCT1Q6UXD1 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
HRCT1Q6UXD1 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
HRCT1Q6UXD1 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
HRCT1Q6UXD1 TOLLIP-202ENST00000317204 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
HRCT1Q6UXD1 WDR17-205ENST00000508596 4294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
HRCT1Q6UXD1 MIR497HG-202ENST00000572453 3838 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
HRCT1Q6UXD1 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
HRCT1Q6UXD1 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
HRCT1Q6UXD1 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
HRCT1Q6UXD1 PGAM1P5-202ENST00000552554 2148 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
HRCT1Q6UXD1 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
HRCT1Q6UXD1 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
HRCT1Q6UXD1 GPC6-201ENST00000377047 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
HRCT1Q6UXD1 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
HRCT1Q6UXD1 BCAR1-208ENST00000542031 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
HRCT1Q6UXD1 MTCL1-202ENST00000359865 6093 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.81
HRCT1Q6UXD1 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
HRCT1Q6UXD1 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
HRCT1Q6UXD1 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
HRCT1Q6UXD1 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
HRCT1Q6UXD1 TNN-202ENST00000621086 4234 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
HRCT1Q6UXD1 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
HRCT1Q6UXD1 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.81
HRCT1Q6UXD1 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
HRCT1Q6UXD1 ARAF-203ENST00000377045 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
HRCT1Q6UXD1 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.81
HRCT1Q6UXD1 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.81
HRCT1Q6UXD1 ERAP1-201ENST00000296754 5495 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
HRCT1Q6UXD1 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.81
HRCT1Q6UXD1 UHMK1-203ENST00000538489 8446 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
HRCT1Q6UXD1 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
HRCT1Q6UXD1 BDH1-201ENST00000358186 3330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
HRCT1Q6UXD1 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.81
HRCT1Q6UXD1 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
HRCT1Q6UXD1 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
HRCT1Q6UXD1 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
HRCT1Q6UXD1 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
HRCT1Q6UXD1 SH3PXD2B-201ENST00000311601 7777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
HRCT1Q6UXD1 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
HRCT1Q6UXD1 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
HRCT1Q6UXD1 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
HRCT1Q6UXD1 CCT8L2-201ENST00000359963 2060 ntAPPRIS P1 BASIC9.96□□□□□ -0.81
HRCT1Q6UXD1 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
HRCT1Q6UXD1 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
HRCT1Q6UXD1 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
HRCT1Q6UXD1 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
HRCT1Q6UXD1 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
HRCT1Q6UXD1 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
HRCT1Q6UXD1 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
HRCT1Q6UXD1 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
HRCT1Q6UXD1 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
HRCT1Q6UXD1 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
HRCT1Q6UXD1 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
HRCT1Q6UXD1 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
HRCT1Q6UXD1 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
HRCT1Q6UXD1 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
HRCT1Q6UXD1 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
HRCT1Q6UXD1 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
HRCT1Q6UXD1 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
HRCT1Q6UXD1 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
HRCT1Q6UXD1 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
HRCT1Q6UXD1 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
HRCT1Q6UXD1 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
HRCT1Q6UXD1 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
HRCT1Q6UXD1 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC9.96□□□□□ -0.82
HRCT1Q6UXD1 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
HRCT1Q6UXD1 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
HRCT1Q6UXD1 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
HRCT1Q6UXD1 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
HRCT1Q6UXD1 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
HRCT1Q6UXD1 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
HRCT1Q6UXD1 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
HRCT1Q6UXD1 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
HRCT1Q6UXD1 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
HRCT1Q6UXD1 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
HRCT1Q6UXD1 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
HRCT1Q6UXD1 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
HRCT1Q6UXD1 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
HRCT1Q6UXD1 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
HRCT1Q6UXD1 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
HRCT1Q6UXD1 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
HRCT1Q6UXD1 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
HRCT1Q6UXD1 WASHC5-202ENST00000517845 3667 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
HRCT1Q6UXD1 ACTR2-202ENST00000377982 2685 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
HRCT1Q6UXD1 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
HRCT1Q6UXD1 TMEM229B-207ENST00000557006 3941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
HRCT1Q6UXD1 NDUFS7-202ENST00000313408 2818 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms