Protein–RNA interactions for Protein: Q6P435

Putative uncharacterized SMG1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6P435 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q6P435 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q6P435 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q6P435 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q6P435 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q6P435 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q6P435 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q6P435 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q6P435 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q6P435 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q6P435 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q6P435 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q6P435 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q6P435 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q6P435 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q6P435 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q6P435 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q6P435 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q6P435 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q6P435 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q6P435 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q6P435 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q6P435 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q6P435 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Q6P435 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q6P435 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q6P435 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Q6P435 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q6P435 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q6P435 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q6P435 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q6P435 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Q6P435 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Q6P435 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Q6P435 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Q6P435 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q6P435 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Q6P435 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q6P435 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q6P435 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q6P435 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q6P435 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q6P435 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q6P435 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q6P435 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q6P435 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q6P435 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q6P435 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q6P435 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q6P435 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q6P435 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q6P435 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q6P435 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q6P435 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q6P435 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q6P435 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q6P435 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q6P435 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q6P435 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q6P435 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q6P435 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q6P435 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q6P435 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Q6P435 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q6P435 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q6P435 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q6P435 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q6P435 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q6P435 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q6P435 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q6P435 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q6P435 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q6P435 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q6P435 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q6P435 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q6P435 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q6P435 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q6P435 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q6P435 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q6P435 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q6P435 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q6P435 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q6P435 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q6P435 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q6P435 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q6P435 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Q6P435 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q6P435 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q6P435 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Q6P435 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Q6P435 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q6P435 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q6P435 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q6P435 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q6P435 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q6P435 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q6P435 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q6P435 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q6P435 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q6P435 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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