Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSJ5

LRRC8E, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8E, humanhuman

Predictions only

Length 796 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC8EQ6NSJ5 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LRRC8EQ6NSJ5 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LRRC8EQ6NSJ5 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LRRC8EQ6NSJ5 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LRRC8EQ6NSJ5 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LRRC8EQ6NSJ5 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LRRC8EQ6NSJ5 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LRRC8EQ6NSJ5 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LRRC8EQ6NSJ5 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LRRC8EQ6NSJ5 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LRRC8EQ6NSJ5 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
LRRC8EQ6NSJ5 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LRRC8EQ6NSJ5 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LRRC8EQ6NSJ5 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LRRC8EQ6NSJ5 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LRRC8EQ6NSJ5 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LRRC8EQ6NSJ5 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LRRC8EQ6NSJ5 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
LRRC8EQ6NSJ5 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LRRC8EQ6NSJ5 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LRRC8EQ6NSJ5 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LRRC8EQ6NSJ5 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LRRC8EQ6NSJ5 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LRRC8EQ6NSJ5 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LRRC8EQ6NSJ5 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LRRC8EQ6NSJ5 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LRRC8EQ6NSJ5 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LRRC8EQ6NSJ5 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
LRRC8EQ6NSJ5 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LRRC8EQ6NSJ5 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LRRC8EQ6NSJ5 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LRRC8EQ6NSJ5 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LRRC8EQ6NSJ5 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LRRC8EQ6NSJ5 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LRRC8EQ6NSJ5 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LRRC8EQ6NSJ5 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LRRC8EQ6NSJ5 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LRRC8EQ6NSJ5 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
LRRC8EQ6NSJ5 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LRRC8EQ6NSJ5 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LRRC8EQ6NSJ5 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LRRC8EQ6NSJ5 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LRRC8EQ6NSJ5 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LRRC8EQ6NSJ5 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LRRC8EQ6NSJ5 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LRRC8EQ6NSJ5 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LRRC8EQ6NSJ5 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LRRC8EQ6NSJ5 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
LRRC8EQ6NSJ5 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LRRC8EQ6NSJ5 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LRRC8EQ6NSJ5 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LRRC8EQ6NSJ5 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LRRC8EQ6NSJ5 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LRRC8EQ6NSJ5 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LRRC8EQ6NSJ5 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LRRC8EQ6NSJ5 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LRRC8EQ6NSJ5 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LRRC8EQ6NSJ5 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LRRC8EQ6NSJ5 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LRRC8EQ6NSJ5 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LRRC8EQ6NSJ5 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LRRC8EQ6NSJ5 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LRRC8EQ6NSJ5 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LRRC8EQ6NSJ5 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LRRC8EQ6NSJ5 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LRRC8EQ6NSJ5 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LRRC8EQ6NSJ5 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LRRC8EQ6NSJ5 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LRRC8EQ6NSJ5 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LRRC8EQ6NSJ5 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LRRC8EQ6NSJ5 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LRRC8EQ6NSJ5 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LRRC8EQ6NSJ5 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LRRC8EQ6NSJ5 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LRRC8EQ6NSJ5 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LRRC8EQ6NSJ5 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LRRC8EQ6NSJ5 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LRRC8EQ6NSJ5 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LRRC8EQ6NSJ5 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LRRC8EQ6NSJ5 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
LRRC8EQ6NSJ5 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LRRC8EQ6NSJ5 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LRRC8EQ6NSJ5 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LRRC8EQ6NSJ5 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
LRRC8EQ6NSJ5 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
LRRC8EQ6NSJ5 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LRRC8EQ6NSJ5 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LRRC8EQ6NSJ5 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LRRC8EQ6NSJ5 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
LRRC8EQ6NSJ5 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LRRC8EQ6NSJ5 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LRRC8EQ6NSJ5 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
LRRC8EQ6NSJ5 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
LRRC8EQ6NSJ5 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LRRC8EQ6NSJ5 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
LRRC8EQ6NSJ5 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
LRRC8EQ6NSJ5 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LRRC8EQ6NSJ5 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
LRRC8EQ6NSJ5 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
LRRC8EQ6NSJ5 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56 ms