Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWN6

FAM208B, Protein FAM208B, humanhuman

Predictions only

Length 2,430 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM208BQ5VWN6 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
FAM208BQ5VWN6 CSF2RA-219ENST00000501036 1622 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
FAM208BQ5VWN6 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
FAM208BQ5VWN6 BBS1-203ENST00000455748 1552 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
FAM208BQ5VWN6 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
FAM208BQ5VWN6 ECH1-201ENST00000221418 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
FAM208BQ5VWN6 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
FAM208BQ5VWN6 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
FAM208BQ5VWN6 FAU-201ENST00000279259 461 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
FAM208BQ5VWN6 TNNT2-203ENST00000367315 1083 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
FAM208BQ5VWN6 AC015691.1-201ENST00000394793 535 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
FAM208BQ5VWN6 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
FAM208BQ5VWN6 ZSCAN2-208ENST00000485222 910 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
FAM208BQ5VWN6 AC084346.1-201ENST00000520962 528 ntTSL 4 BASIC13.93□□□□□ -0.18
FAM208BQ5VWN6 ZSCAN2-210ENST00000538076 1109 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
FAM208BQ5VWN6 AC087392.5-201ENST00000612517 489 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
FAM208BQ5VWN6 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
FAM208BQ5VWN6 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
FAM208BQ5VWN6 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
FAM208BQ5VWN6 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
FAM208BQ5VWN6 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
FAM208BQ5VWN6 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
FAM208BQ5VWN6 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
FAM208BQ5VWN6 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
FAM208BQ5VWN6 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
FAM208BQ5VWN6 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
FAM208BQ5VWN6 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
FAM208BQ5VWN6 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
FAM208BQ5VWN6 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
FAM208BQ5VWN6 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
FAM208BQ5VWN6 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
FAM208BQ5VWN6 TSPAN3-205ENST00000558745 1340 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
FAM208BQ5VWN6 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
FAM208BQ5VWN6 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
FAM208BQ5VWN6 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
FAM208BQ5VWN6 GNAT1-202ENST00000433068 1224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
FAM208BQ5VWN6 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
FAM208BQ5VWN6 AC002127.2-201ENST00000444032 792 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
FAM208BQ5VWN6 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
FAM208BQ5VWN6 AP000911.2-201ENST00000534330 502 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
FAM208BQ5VWN6 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
FAM208BQ5VWN6 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
FAM208BQ5VWN6 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
FAM208BQ5VWN6 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
FAM208BQ5VWN6 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
FAM208BQ5VWN6 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
FAM208BQ5VWN6 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
FAM208BQ5VWN6 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
FAM208BQ5VWN6 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
FAM208BQ5VWN6 PPP1R1B-202ENST00000394265 1419 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
FAM208BQ5VWN6 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
FAM208BQ5VWN6 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
FAM208BQ5VWN6 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
FAM208BQ5VWN6 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
FAM208BQ5VWN6 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
FAM208BQ5VWN6 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
FAM208BQ5VWN6 UQCC2-201ENST00000374214 432 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
FAM208BQ5VWN6 FAM9C-202ENST00000380625 1122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
FAM208BQ5VWN6 AL592076.1-201ENST00000424448 303 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
FAM208BQ5VWN6 RBPMSLP-201ENST00000433427 502 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
FAM208BQ5VWN6 IGHV3-43-201ENST00000434710 434 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
FAM208BQ5VWN6 AC092295.1-201ENST00000446262 434 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
FAM208BQ5VWN6 AC093909.3-201ENST00000504783 336 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
FAM208BQ5VWN6 CYB561A3-208ENST00000536915 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
FAM208BQ5VWN6 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
FAM208BQ5VWN6 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
FAM208BQ5VWN6 LINC00923-205ENST00000615399 932 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
FAM208BQ5VWN6 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
FAM208BQ5VWN6 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
FAM208BQ5VWN6 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
FAM208BQ5VWN6 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
FAM208BQ5VWN6 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
FAM208BQ5VWN6 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
FAM208BQ5VWN6 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
FAM208BQ5VWN6 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
FAM208BQ5VWN6 HERPUD1-202ENST00000344114 1388 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
FAM208BQ5VWN6 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
FAM208BQ5VWN6 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
FAM208BQ5VWN6 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
FAM208BQ5VWN6 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
FAM208BQ5VWN6 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
FAM208BQ5VWN6 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
FAM208BQ5VWN6 LAIR2-201ENST00000301202 699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
FAM208BQ5VWN6 TMEM95-202ENST00000389982 1191 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
FAM208BQ5VWN6 IGLC1-201ENST00000390321 460 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
FAM208BQ5VWN6 THYN1-203ENST00000392594 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
FAM208BQ5VWN6 STK16-203ENST00000409516 895 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
FAM208BQ5VWN6 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
FAM208BQ5VWN6 AC019118.2-201ENST00000425776 718 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
FAM208BQ5VWN6 AC073569.2-201ENST00000551995 354 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
FAM208BQ5VWN6 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
FAM208BQ5VWN6 PHF23-213ENST00000613632 850 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
FAM208BQ5VWN6 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
FAM208BQ5VWN6 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
FAM208BQ5VWN6 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
FAM208BQ5VWN6 MEIKIN-205ENST00000616644 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
FAM208BQ5VWN6 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
FAM208BQ5VWN6 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
FAM208BQ5VWN6 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
FAM208BQ5VWN6 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.6 ms