Protein–RNA interactions for Protein: Q5TG30

ARHGAP40, Rho GTPase-activating protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGAP40Q5TG30 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ARHGAP40Q5TG30 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ARHGAP40Q5TG30 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ARHGAP40Q5TG30 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ARHGAP40Q5TG30 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ARHGAP40Q5TG30 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ARHGAP40Q5TG30 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ARHGAP40Q5TG30 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ARHGAP40Q5TG30 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ARHGAP40Q5TG30 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ARHGAP40Q5TG30 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ARHGAP40Q5TG30 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ARHGAP40Q5TG30 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ARHGAP40Q5TG30 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ARHGAP40Q5TG30 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ARHGAP40Q5TG30 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ARHGAP40Q5TG30 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ARHGAP40Q5TG30 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ARHGAP40Q5TG30 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ARHGAP40Q5TG30 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ARHGAP40Q5TG30 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ARHGAP40Q5TG30 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ARHGAP40Q5TG30 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ARHGAP40Q5TG30 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ARHGAP40Q5TG30 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ARHGAP40Q5TG30 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ARHGAP40Q5TG30 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ARHGAP40Q5TG30 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ARHGAP40Q5TG30 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ARHGAP40Q5TG30 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ARHGAP40Q5TG30 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ARHGAP40Q5TG30 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ARHGAP40Q5TG30 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ARHGAP40Q5TG30 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ARHGAP40Q5TG30 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ARHGAP40Q5TG30 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ARHGAP40Q5TG30 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ARHGAP40Q5TG30 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ARHGAP40Q5TG30 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ARHGAP40Q5TG30 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ARHGAP40Q5TG30 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ARHGAP40Q5TG30 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ARHGAP40Q5TG30 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ARHGAP40Q5TG30 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ARHGAP40Q5TG30 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ARHGAP40Q5TG30 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ARHGAP40Q5TG30 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ARHGAP40Q5TG30 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ARHGAP40Q5TG30 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ARHGAP40Q5TG30 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ARHGAP40Q5TG30 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ARHGAP40Q5TG30 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ARHGAP40Q5TG30 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ARHGAP40Q5TG30 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ARHGAP40Q5TG30 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ARHGAP40Q5TG30 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ARHGAP40Q5TG30 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ARHGAP40Q5TG30 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ARHGAP40Q5TG30 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ARHGAP40Q5TG30 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ARHGAP40Q5TG30 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ARHGAP40Q5TG30 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ARHGAP40Q5TG30 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ARHGAP40Q5TG30 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ARHGAP40Q5TG30 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ARHGAP40Q5TG30 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ARHGAP40Q5TG30 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ARHGAP40Q5TG30 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ARHGAP40Q5TG30 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ARHGAP40Q5TG30 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ARHGAP40Q5TG30 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
ARHGAP40Q5TG30 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ARHGAP40Q5TG30 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ARHGAP40Q5TG30 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
ARHGAP40Q5TG30 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ARHGAP40Q5TG30 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ARHGAP40Q5TG30 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ARHGAP40Q5TG30 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
ARHGAP40Q5TG30 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ARHGAP40Q5TG30 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ARHGAP40Q5TG30 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ARHGAP40Q5TG30 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ARHGAP40Q5TG30 LGALS9C-215ENST00000584941 1104 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ARHGAP40Q5TG30 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ARHGAP40Q5TG30 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ARHGAP40Q5TG30 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ARHGAP40Q5TG30 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ARHGAP40Q5TG30 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
ARHGAP40Q5TG30 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ARHGAP40Q5TG30 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ARHGAP40Q5TG30 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ARHGAP40Q5TG30 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ARHGAP40Q5TG30 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
ARHGAP40Q5TG30 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ARHGAP40Q5TG30 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ARHGAP40Q5TG30 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ARHGAP40Q5TG30 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ARHGAP40Q5TG30 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ARHGAP40Q5TG30 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ARHGAP40Q5TG30 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.3 ms