Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWW7

C10orf55, Uncharacterized protein C10orf55, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C10orf55Q5SWW7 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
C10orf55Q5SWW7 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
C10orf55Q5SWW7 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
C10orf55Q5SWW7 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
C10orf55Q5SWW7 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
C10orf55Q5SWW7 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
C10orf55Q5SWW7 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
C10orf55Q5SWW7 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
C10orf55Q5SWW7 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
C10orf55Q5SWW7 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
C10orf55Q5SWW7 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
C10orf55Q5SWW7 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
C10orf55Q5SWW7 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
C10orf55Q5SWW7 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
C10orf55Q5SWW7 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
C10orf55Q5SWW7 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
C10orf55Q5SWW7 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
C10orf55Q5SWW7 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC12.61□□□□□ -0.39
C10orf55Q5SWW7 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
C10orf55Q5SWW7 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
C10orf55Q5SWW7 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
C10orf55Q5SWW7 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
C10orf55Q5SWW7 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
C10orf55Q5SWW7 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
C10orf55Q5SWW7 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
C10orf55Q5SWW7 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
C10orf55Q5SWW7 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
C10orf55Q5SWW7 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
C10orf55Q5SWW7 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
C10orf55Q5SWW7 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
C10orf55Q5SWW7 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
C10orf55Q5SWW7 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
C10orf55Q5SWW7 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
C10orf55Q5SWW7 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
C10orf55Q5SWW7 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
C10orf55Q5SWW7 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
C10orf55Q5SWW7 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
C10orf55Q5SWW7 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
C10orf55Q5SWW7 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
C10orf55Q5SWW7 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
C10orf55Q5SWW7 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
C10orf55Q5SWW7 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
C10orf55Q5SWW7 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
C10orf55Q5SWW7 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
C10orf55Q5SWW7 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
C10orf55Q5SWW7 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
C10orf55Q5SWW7 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
C10orf55Q5SWW7 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
C10orf55Q5SWW7 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
C10orf55Q5SWW7 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
C10orf55Q5SWW7 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
C10orf55Q5SWW7 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
C10orf55Q5SWW7 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
C10orf55Q5SWW7 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
C10orf55Q5SWW7 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
C10orf55Q5SWW7 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
C10orf55Q5SWW7 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
C10orf55Q5SWW7 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
C10orf55Q5SWW7 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
C10orf55Q5SWW7 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
C10orf55Q5SWW7 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
C10orf55Q5SWW7 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
C10orf55Q5SWW7 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
C10orf55Q5SWW7 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
C10orf55Q5SWW7 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
C10orf55Q5SWW7 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
C10orf55Q5SWW7 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
C10orf55Q5SWW7 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
C10orf55Q5SWW7 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
C10orf55Q5SWW7 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
C10orf55Q5SWW7 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
C10orf55Q5SWW7 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
C10orf55Q5SWW7 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
C10orf55Q5SWW7 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
C10orf55Q5SWW7 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
C10orf55Q5SWW7 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
C10orf55Q5SWW7 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
C10orf55Q5SWW7 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
C10orf55Q5SWW7 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
C10orf55Q5SWW7 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
C10orf55Q5SWW7 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
C10orf55Q5SWW7 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
C10orf55Q5SWW7 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
C10orf55Q5SWW7 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
C10orf55Q5SWW7 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
C10orf55Q5SWW7 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
C10orf55Q5SWW7 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
C10orf55Q5SWW7 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
C10orf55Q5SWW7 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
C10orf55Q5SWW7 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
C10orf55Q5SWW7 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
C10orf55Q5SWW7 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
C10orf55Q5SWW7 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC12.6□□□□□ -0.39
C10orf55Q5SWW7 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
C10orf55Q5SWW7 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
C10orf55Q5SWW7 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
C10orf55Q5SWW7 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
C10orf55Q5SWW7 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
C10orf55Q5SWW7 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
C10orf55Q5SWW7 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms