Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW79

CEP170, Centrosomal protein of 170 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 1,584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP170Q5SW79 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CEP170Q5SW79 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CEP170Q5SW79 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CEP170Q5SW79 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CEP170Q5SW79 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CEP170Q5SW79 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CEP170Q5SW79 UBXN7-AS1-201ENST00000442941 386 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CEP170Q5SW79 AC079112.1-201ENST00000454972 939 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CEP170Q5SW79 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CEP170Q5SW79 AC012379.2-201ENST00000560237 765 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CEP170Q5SW79 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CEP170Q5SW79 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CEP170Q5SW79 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CEP170Q5SW79 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CEP170Q5SW79 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CEP170Q5SW79 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CEP170Q5SW79 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CEP170Q5SW79 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CEP170Q5SW79 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CEP170Q5SW79 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CEP170Q5SW79 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CEP170Q5SW79 AC004973.1-201ENST00000413240 635 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CEP170Q5SW79 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CEP170Q5SW79 VDAC3-211ENST00000522572 799 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CEP170Q5SW79 AP005901.3-201ENST00000581666 415 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CEP170Q5SW79 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CEP170Q5SW79 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CEP170Q5SW79 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CEP170Q5SW79 AC005618.3-201ENST00000624928 458 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CEP170Q5SW79 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CEP170Q5SW79 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CEP170Q5SW79 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CEP170Q5SW79 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CEP170Q5SW79 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CEP170Q5SW79 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CEP170Q5SW79 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CEP170Q5SW79 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CEP170Q5SW79 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CEP170Q5SW79 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CEP170Q5SW79 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CEP170Q5SW79 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CEP170Q5SW79 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CEP170Q5SW79 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CEP170Q5SW79 RASSF3-202ENST00000336061 1030 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CEP170Q5SW79 AC012362.1-201ENST00000434906 739 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CEP170Q5SW79 LINC00466-203ENST00000436475 1059 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CEP170Q5SW79 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CEP170Q5SW79 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CEP170Q5SW79 AC004869.1-201ENST00000440935 540 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CEP170Q5SW79 RPL7P35-201ENST00000446943 740 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CEP170Q5SW79 NCK1-AS1-203ENST00000474250 827 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CEP170Q5SW79 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CEP170Q5SW79 AC092139.2-201ENST00000563750 754 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CEP170Q5SW79 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CEP170Q5SW79 ROPN1-211ENST00000620893 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CEP170Q5SW79 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CEP170Q5SW79 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CEP170Q5SW79 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CEP170Q5SW79 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CEP170Q5SW79 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CEP170Q5SW79 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CEP170Q5SW79 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CEP170Q5SW79 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CEP170Q5SW79 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CEP170Q5SW79 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CEP170Q5SW79 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CEP170Q5SW79 PLEKHA8P1-203ENST00000545609 277 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CEP170Q5SW79 REC114-202ENST00000560581 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CEP170Q5SW79 NPTN-204ENST00000562924 1094 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CEP170Q5SW79 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CEP170Q5SW79 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CEP170Q5SW79 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CEP170Q5SW79 OARD1-203ENST00000463088 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CEP170Q5SW79 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CEP170Q5SW79 FAM151A-202ENST00000371304 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CEP170Q5SW79 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CEP170Q5SW79 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CEP170Q5SW79 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CEP170Q5SW79 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CEP170Q5SW79 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CEP170Q5SW79 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CEP170Q5SW79 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CEP170Q5SW79 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CEP170Q5SW79 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CEP170Q5SW79 AC108199.1-201ENST00000504249 508 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CEP170Q5SW79 AC103810.10-201ENST00000606504 343 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CEP170Q5SW79 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CEP170Q5SW79 CMC2-224ENST00000630396 481 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CEP170Q5SW79 CASP16P-204ENST00000635032 809 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CEP170Q5SW79 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CEP170Q5SW79 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CEP170Q5SW79 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CEP170Q5SW79 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CEP170Q5SW79 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CEP170Q5SW79 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CEP170Q5SW79 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CEP170Q5SW79 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CEP170Q5SW79 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CEP170Q5SW79 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CEP170Q5SW79 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms