Protein–RNA interactions for Protein: Q5EBL2

ZNF628, Zinc finger protein 628, humanhuman

Predictions only

Length 1,059 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF628Q5EBL2 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF628Q5EBL2 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF628Q5EBL2 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF628Q5EBL2 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF628Q5EBL2 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF628Q5EBL2 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF628Q5EBL2 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF628Q5EBL2 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF628Q5EBL2 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF628Q5EBL2 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF628Q5EBL2 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF628Q5EBL2 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF628Q5EBL2 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF628Q5EBL2 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF628Q5EBL2 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF628Q5EBL2 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF628Q5EBL2 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF628Q5EBL2 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF628Q5EBL2 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF628Q5EBL2 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF628Q5EBL2 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF628Q5EBL2 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF628Q5EBL2 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF628Q5EBL2 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF628Q5EBL2 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF628Q5EBL2 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF628Q5EBL2 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF628Q5EBL2 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF628Q5EBL2 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF628Q5EBL2 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF628Q5EBL2 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF628Q5EBL2 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF628Q5EBL2 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF628Q5EBL2 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF628Q5EBL2 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF628Q5EBL2 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF628Q5EBL2 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF628Q5EBL2 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF628Q5EBL2 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF628Q5EBL2 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF628Q5EBL2 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF628Q5EBL2 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF628Q5EBL2 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF628Q5EBL2 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF628Q5EBL2 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF628Q5EBL2 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF628Q5EBL2 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF628Q5EBL2 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF628Q5EBL2 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF628Q5EBL2 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF628Q5EBL2 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF628Q5EBL2 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF628Q5EBL2 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF628Q5EBL2 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF628Q5EBL2 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF628Q5EBL2 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF628Q5EBL2 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF628Q5EBL2 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF628Q5EBL2 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF628Q5EBL2 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF628Q5EBL2 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF628Q5EBL2 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF628Q5EBL2 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF628Q5EBL2 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF628Q5EBL2 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF628Q5EBL2 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF628Q5EBL2 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF628Q5EBL2 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF628Q5EBL2 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF628Q5EBL2 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF628Q5EBL2 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF628Q5EBL2 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF628Q5EBL2 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF628Q5EBL2 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF628Q5EBL2 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF628Q5EBL2 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF628Q5EBL2 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF628Q5EBL2 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF628Q5EBL2 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF628Q5EBL2 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF628Q5EBL2 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF628Q5EBL2 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF628Q5EBL2 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF628Q5EBL2 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF628Q5EBL2 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF628Q5EBL2 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF628Q5EBL2 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF628Q5EBL2 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF628Q5EBL2 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF628Q5EBL2 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF628Q5EBL2 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF628Q5EBL2 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF628Q5EBL2 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF628Q5EBL2 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF628Q5EBL2 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF628Q5EBL2 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF628Q5EBL2 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF628Q5EBL2 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF628Q5EBL2 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF628Q5EBL2 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms