Protein–RNA interactions for Protein: Q5BKX8

CAVIN4, Caveolae-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN4Q5BKX8 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
CAVIN4Q5BKX8 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
CAVIN4Q5BKX8 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CAVIN4Q5BKX8 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CAVIN4Q5BKX8 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CAVIN4Q5BKX8 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CAVIN4Q5BKX8 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
CAVIN4Q5BKX8 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
CAVIN4Q5BKX8 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CAVIN4Q5BKX8 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CAVIN4Q5BKX8 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CAVIN4Q5BKX8 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CAVIN4Q5BKX8 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CAVIN4Q5BKX8 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CAVIN4Q5BKX8 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CAVIN4Q5BKX8 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CAVIN4Q5BKX8 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CAVIN4Q5BKX8 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CAVIN4Q5BKX8 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CAVIN4Q5BKX8 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CAVIN4Q5BKX8 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CAVIN4Q5BKX8 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CAVIN4Q5BKX8 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CAVIN4Q5BKX8 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CAVIN4Q5BKX8 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CAVIN4Q5BKX8 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CAVIN4Q5BKX8 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CAVIN4Q5BKX8 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CAVIN4Q5BKX8 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CAVIN4Q5BKX8 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CAVIN4Q5BKX8 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CAVIN4Q5BKX8 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CAVIN4Q5BKX8 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CAVIN4Q5BKX8 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CAVIN4Q5BKX8 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
CAVIN4Q5BKX8 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CAVIN4Q5BKX8 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CAVIN4Q5BKX8 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CAVIN4Q5BKX8 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CAVIN4Q5BKX8 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CAVIN4Q5BKX8 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
CAVIN4Q5BKX8 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CAVIN4Q5BKX8 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CAVIN4Q5BKX8 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CAVIN4Q5BKX8 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CAVIN4Q5BKX8 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
CAVIN4Q5BKX8 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CAVIN4Q5BKX8 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CAVIN4Q5BKX8 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CAVIN4Q5BKX8 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CAVIN4Q5BKX8 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CAVIN4Q5BKX8 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CAVIN4Q5BKX8 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CAVIN4Q5BKX8 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CAVIN4Q5BKX8 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.62
CAVIN4Q5BKX8 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CAVIN4Q5BKX8 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CAVIN4Q5BKX8 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CAVIN4Q5BKX8 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CAVIN4Q5BKX8 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CAVIN4Q5BKX8 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CAVIN4Q5BKX8 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CAVIN4Q5BKX8 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CAVIN4Q5BKX8 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CAVIN4Q5BKX8 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CAVIN4Q5BKX8 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CAVIN4Q5BKX8 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CAVIN4Q5BKX8 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CAVIN4Q5BKX8 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CAVIN4Q5BKX8 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CAVIN4Q5BKX8 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CAVIN4Q5BKX8 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CAVIN4Q5BKX8 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CAVIN4Q5BKX8 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CAVIN4Q5BKX8 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CAVIN4Q5BKX8 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CAVIN4Q5BKX8 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CAVIN4Q5BKX8 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CAVIN4Q5BKX8 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CAVIN4Q5BKX8 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CAVIN4Q5BKX8 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CAVIN4Q5BKX8 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CAVIN4Q5BKX8 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CAVIN4Q5BKX8 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CAVIN4Q5BKX8 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CAVIN4Q5BKX8 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CAVIN4Q5BKX8 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CAVIN4Q5BKX8 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CAVIN4Q5BKX8 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CAVIN4Q5BKX8 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CAVIN4Q5BKX8 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CAVIN4Q5BKX8 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CAVIN4Q5BKX8 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CAVIN4Q5BKX8 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CAVIN4Q5BKX8 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CAVIN4Q5BKX8 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CAVIN4Q5BKX8 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CAVIN4Q5BKX8 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CAVIN4Q5BKX8 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CAVIN4Q5BKX8 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
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