Protein–RNA interactions for Protein: Q53S08

RAB6C, Rab6C, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6CQ53S08 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAB6CQ53S08 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAB6CQ53S08 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAB6CQ53S08 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAB6CQ53S08 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAB6CQ53S08 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAB6CQ53S08 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAB6CQ53S08 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAB6CQ53S08 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAB6CQ53S08 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAB6CQ53S08 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAB6CQ53S08 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAB6CQ53S08 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAB6CQ53S08 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAB6CQ53S08 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAB6CQ53S08 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAB6CQ53S08 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAB6CQ53S08 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAB6CQ53S08 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAB6CQ53S08 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAB6CQ53S08 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAB6CQ53S08 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAB6CQ53S08 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAB6CQ53S08 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAB6CQ53S08 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
RAB6CQ53S08 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAB6CQ53S08 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
RAB6CQ53S08 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAB6CQ53S08 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
RAB6CQ53S08 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAB6CQ53S08 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAB6CQ53S08 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAB6CQ53S08 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAB6CQ53S08 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAB6CQ53S08 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAB6CQ53S08 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAB6CQ53S08 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAB6CQ53S08 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAB6CQ53S08 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAB6CQ53S08 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAB6CQ53S08 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAB6CQ53S08 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAB6CQ53S08 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
RAB6CQ53S08 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
RAB6CQ53S08 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAB6CQ53S08 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAB6CQ53S08 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
RAB6CQ53S08 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAB6CQ53S08 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
RAB6CQ53S08 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
RAB6CQ53S08 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
RAB6CQ53S08 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAB6CQ53S08 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
RAB6CQ53S08 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
RAB6CQ53S08 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAB6CQ53S08 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAB6CQ53S08 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAB6CQ53S08 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAB6CQ53S08 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAB6CQ53S08 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAB6CQ53S08 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAB6CQ53S08 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAB6CQ53S08 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAB6CQ53S08 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAB6CQ53S08 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAB6CQ53S08 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAB6CQ53S08 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAB6CQ53S08 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAB6CQ53S08 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAB6CQ53S08 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAB6CQ53S08 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAB6CQ53S08 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
RAB6CQ53S08 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAB6CQ53S08 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAB6CQ53S08 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAB6CQ53S08 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAB6CQ53S08 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAB6CQ53S08 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAB6CQ53S08 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAB6CQ53S08 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAB6CQ53S08 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAB6CQ53S08 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAB6CQ53S08 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAB6CQ53S08 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAB6CQ53S08 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
RAB6CQ53S08 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAB6CQ53S08 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAB6CQ53S08 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAB6CQ53S08 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAB6CQ53S08 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAB6CQ53S08 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAB6CQ53S08 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAB6CQ53S08 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAB6CQ53S08 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
RAB6CQ53S08 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAB6CQ53S08 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAB6CQ53S08 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAB6CQ53S08 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAB6CQ53S08 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAB6CQ53S08 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76 ms