Protein–RNA interactions for Protein: Q52LD8

RFTN2, Raftlin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN2Q52LD8 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RFTN2Q52LD8 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RFTN2Q52LD8 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RFTN2Q52LD8 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RFTN2Q52LD8 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RFTN2Q52LD8 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RFTN2Q52LD8 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RFTN2Q52LD8 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RFTN2Q52LD8 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RFTN2Q52LD8 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RFTN2Q52LD8 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RFTN2Q52LD8 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RFTN2Q52LD8 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RFTN2Q52LD8 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RFTN2Q52LD8 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RFTN2Q52LD8 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RFTN2Q52LD8 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RFTN2Q52LD8 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
RFTN2Q52LD8 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RFTN2Q52LD8 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RFTN2Q52LD8 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RFTN2Q52LD8 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RFTN2Q52LD8 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RFTN2Q52LD8 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RFTN2Q52LD8 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RFTN2Q52LD8 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RFTN2Q52LD8 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RFTN2Q52LD8 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RFTN2Q52LD8 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RFTN2Q52LD8 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RFTN2Q52LD8 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RFTN2Q52LD8 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RFTN2Q52LD8 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RFTN2Q52LD8 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RFTN2Q52LD8 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
RFTN2Q52LD8 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RFTN2Q52LD8 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RFTN2Q52LD8 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RFTN2Q52LD8 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RFTN2Q52LD8 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RFTN2Q52LD8 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RFTN2Q52LD8 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RFTN2Q52LD8 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
RFTN2Q52LD8 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RFTN2Q52LD8 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RFTN2Q52LD8 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RFTN2Q52LD8 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RFTN2Q52LD8 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RFTN2Q52LD8 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RFTN2Q52LD8 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RFTN2Q52LD8 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RFTN2Q52LD8 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RFTN2Q52LD8 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RFTN2Q52LD8 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RFTN2Q52LD8 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RFTN2Q52LD8 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RFTN2Q52LD8 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RFTN2Q52LD8 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RFTN2Q52LD8 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RFTN2Q52LD8 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RFTN2Q52LD8 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
RFTN2Q52LD8 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RFTN2Q52LD8 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RFTN2Q52LD8 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RFTN2Q52LD8 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RFTN2Q52LD8 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RFTN2Q52LD8 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RFTN2Q52LD8 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RFTN2Q52LD8 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RFTN2Q52LD8 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RFTN2Q52LD8 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
RFTN2Q52LD8 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RFTN2Q52LD8 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RFTN2Q52LD8 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RFTN2Q52LD8 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RFTN2Q52LD8 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RFTN2Q52LD8 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RFTN2Q52LD8 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RFTN2Q52LD8 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RFTN2Q52LD8 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RFTN2Q52LD8 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RFTN2Q52LD8 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RFTN2Q52LD8 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RFTN2Q52LD8 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RFTN2Q52LD8 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RFTN2Q52LD8 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RFTN2Q52LD8 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
RFTN2Q52LD8 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RFTN2Q52LD8 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RFTN2Q52LD8 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RFTN2Q52LD8 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RFTN2Q52LD8 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RFTN2Q52LD8 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RFTN2Q52LD8 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RFTN2Q52LD8 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RFTN2Q52LD8 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RFTN2Q52LD8 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RFTN2Q52LD8 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RFTN2Q52LD8 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RFTN2Q52LD8 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms