Protein–RNA interactions for Protein: Q4VX76

SYTL3, Synaptotagmin-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYTL3Q4VX76 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SYTL3Q4VX76 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SYTL3Q4VX76 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SYTL3Q4VX76 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SYTL3Q4VX76 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SYTL3Q4VX76 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SYTL3Q4VX76 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SYTL3Q4VX76 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SYTL3Q4VX76 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SYTL3Q4VX76 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SYTL3Q4VX76 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SYTL3Q4VX76 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SYTL3Q4VX76 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SYTL3Q4VX76 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SYTL3Q4VX76 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SYTL3Q4VX76 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SYTL3Q4VX76 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SYTL3Q4VX76 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SYTL3Q4VX76 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SYTL3Q4VX76 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SYTL3Q4VX76 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SYTL3Q4VX76 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SYTL3Q4VX76 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SYTL3Q4VX76 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SYTL3Q4VX76 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SYTL3Q4VX76 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SYTL3Q4VX76 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SYTL3Q4VX76 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SYTL3Q4VX76 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SYTL3Q4VX76 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SYTL3Q4VX76 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SYTL3Q4VX76 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SYTL3Q4VX76 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SYTL3Q4VX76 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SYTL3Q4VX76 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SYTL3Q4VX76 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SYTL3Q4VX76 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SYTL3Q4VX76 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SYTL3Q4VX76 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SYTL3Q4VX76 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SYTL3Q4VX76 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SYTL3Q4VX76 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SYTL3Q4VX76 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SYTL3Q4VX76 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SYTL3Q4VX76 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SYTL3Q4VX76 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SYTL3Q4VX76 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SYTL3Q4VX76 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SYTL3Q4VX76 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SYTL3Q4VX76 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SYTL3Q4VX76 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SYTL3Q4VX76 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SYTL3Q4VX76 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SYTL3Q4VX76 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SYTL3Q4VX76 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SYTL3Q4VX76 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SYTL3Q4VX76 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SYTL3Q4VX76 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SYTL3Q4VX76 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SYTL3Q4VX76 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SYTL3Q4VX76 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SYTL3Q4VX76 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SYTL3Q4VX76 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SYTL3Q4VX76 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SYTL3Q4VX76 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SYTL3Q4VX76 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SYTL3Q4VX76 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SYTL3Q4VX76 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SYTL3Q4VX76 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SYTL3Q4VX76 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SYTL3Q4VX76 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SYTL3Q4VX76 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SYTL3Q4VX76 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SYTL3Q4VX76 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SYTL3Q4VX76 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SYTL3Q4VX76 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SYTL3Q4VX76 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SYTL3Q4VX76 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SYTL3Q4VX76 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SYTL3Q4VX76 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SYTL3Q4VX76 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SYTL3Q4VX76 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SYTL3Q4VX76 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SYTL3Q4VX76 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SYTL3Q4VX76 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SYTL3Q4VX76 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SYTL3Q4VX76 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SYTL3Q4VX76 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SYTL3Q4VX76 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SYTL3Q4VX76 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SYTL3Q4VX76 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SYTL3Q4VX76 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SYTL3Q4VX76 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SYTL3Q4VX76 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SYTL3Q4VX76 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SYTL3Q4VX76 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SYTL3Q4VX76 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SYTL3Q4VX76 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SYTL3Q4VX76 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SYTL3Q4VX76 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms