Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CSPP1Q1MSJ5 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CSPP1Q1MSJ5 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CSPP1Q1MSJ5 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CSPP1Q1MSJ5 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CSPP1Q1MSJ5 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CSPP1Q1MSJ5 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CSPP1Q1MSJ5 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CSPP1Q1MSJ5 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CSPP1Q1MSJ5 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CSPP1Q1MSJ5 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CSPP1Q1MSJ5 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CSPP1Q1MSJ5 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CSPP1Q1MSJ5 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CSPP1Q1MSJ5 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CSPP1Q1MSJ5 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CSPP1Q1MSJ5 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CSPP1Q1MSJ5 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CSPP1Q1MSJ5 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CSPP1Q1MSJ5 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CSPP1Q1MSJ5 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CSPP1Q1MSJ5 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CSPP1Q1MSJ5 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CSPP1Q1MSJ5 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CSPP1Q1MSJ5 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CSPP1Q1MSJ5 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CSPP1Q1MSJ5 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CSPP1Q1MSJ5 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CSPP1Q1MSJ5 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CSPP1Q1MSJ5 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CSPP1Q1MSJ5 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CSPP1Q1MSJ5 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CSPP1Q1MSJ5 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CSPP1Q1MSJ5 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CSPP1Q1MSJ5 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CSPP1Q1MSJ5 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CSPP1Q1MSJ5 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CSPP1Q1MSJ5 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CSPP1Q1MSJ5 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CSPP1Q1MSJ5 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CSPP1Q1MSJ5 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CSPP1Q1MSJ5 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CSPP1Q1MSJ5 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CSPP1Q1MSJ5 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CSPP1Q1MSJ5 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CSPP1Q1MSJ5 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CSPP1Q1MSJ5 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CSPP1Q1MSJ5 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CSPP1Q1MSJ5 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CSPP1Q1MSJ5 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CSPP1Q1MSJ5 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CSPP1Q1MSJ5 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CSPP1Q1MSJ5 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CSPP1Q1MSJ5 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CSPP1Q1MSJ5 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CSPP1Q1MSJ5 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CSPP1Q1MSJ5 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CSPP1Q1MSJ5 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CSPP1Q1MSJ5 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CSPP1Q1MSJ5 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CSPP1Q1MSJ5 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CSPP1Q1MSJ5 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CSPP1Q1MSJ5 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CSPP1Q1MSJ5 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CSPP1Q1MSJ5 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CSPP1Q1MSJ5 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CSPP1Q1MSJ5 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CSPP1Q1MSJ5 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CSPP1Q1MSJ5 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CSPP1Q1MSJ5 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CSPP1Q1MSJ5 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CSPP1Q1MSJ5 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CSPP1Q1MSJ5 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CSPP1Q1MSJ5 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CSPP1Q1MSJ5 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CSPP1Q1MSJ5 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CSPP1Q1MSJ5 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CSPP1Q1MSJ5 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CSPP1Q1MSJ5 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CSPP1Q1MSJ5 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CSPP1Q1MSJ5 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CSPP1Q1MSJ5 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CSPP1Q1MSJ5 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CSPP1Q1MSJ5 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CSPP1Q1MSJ5 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CSPP1Q1MSJ5 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CSPP1Q1MSJ5 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CSPP1Q1MSJ5 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CSPP1Q1MSJ5 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CSPP1Q1MSJ5 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CSPP1Q1MSJ5 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CSPP1Q1MSJ5 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CSPP1Q1MSJ5 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CSPP1Q1MSJ5 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CSPP1Q1MSJ5 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CSPP1Q1MSJ5 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CSPP1Q1MSJ5 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CSPP1Q1MSJ5 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CSPP1Q1MSJ5 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CSPP1Q1MSJ5 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms