Protein–RNA interactions for Protein: Q16836

HADH, Hydroxyacyl-coenzyme A dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HADHQ16836 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
HADHQ16836 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HADHQ16836 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HADHQ16836 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HADHQ16836 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HADHQ16836 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HADHQ16836 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HADHQ16836 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
HADHQ16836 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HADHQ16836 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HADHQ16836 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HADHQ16836 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HADHQ16836 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
HADHQ16836 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HADHQ16836 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HADHQ16836 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HADHQ16836 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HADHQ16836 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HADHQ16836 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HADHQ16836 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HADHQ16836 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HADHQ16836 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HADHQ16836 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HADHQ16836 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
HADHQ16836 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HADHQ16836 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HADHQ16836 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HADHQ16836 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HADHQ16836 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HADHQ16836 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HADHQ16836 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HADHQ16836 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
HADHQ16836 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HADHQ16836 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HADHQ16836 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HADHQ16836 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
HADHQ16836 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
HADHQ16836 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
HADHQ16836 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HADHQ16836 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HADHQ16836 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HADHQ16836 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HADHQ16836 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
HADHQ16836 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HADHQ16836 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
HADHQ16836 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HADHQ16836 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HADHQ16836 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HADHQ16836 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
HADHQ16836 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HADHQ16836 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HADHQ16836 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HADHQ16836 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HADHQ16836 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HADHQ16836 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HADHQ16836 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HADHQ16836 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HADHQ16836 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HADHQ16836 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HADHQ16836 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HADHQ16836 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HADHQ16836 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HADHQ16836 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HADHQ16836 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HADHQ16836 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HADHQ16836 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HADHQ16836 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HADHQ16836 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HADHQ16836 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HADHQ16836 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HADHQ16836 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HADHQ16836 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HADHQ16836 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HADHQ16836 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HADHQ16836 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HADHQ16836 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HADHQ16836 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HADHQ16836 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
HADHQ16836 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HADHQ16836 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HADHQ16836 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HADHQ16836 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HADHQ16836 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
HADHQ16836 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HADHQ16836 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HADHQ16836 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HADHQ16836 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
HADHQ16836 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
HADHQ16836 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HADHQ16836 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
HADHQ16836 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HADHQ16836 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HADHQ16836 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HADHQ16836 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HADHQ16836 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HADHQ16836 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HADHQ16836 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HADHQ16836 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HADHQ16836 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HADHQ16836 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
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