Protein–RNA interactions for Protein: Q16576

RBBP7, Histone-binding protein RBBP7, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP7Q16576 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RBBP7Q16576 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RBBP7Q16576 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RBBP7Q16576 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RBBP7Q16576 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RBBP7Q16576 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RBBP7Q16576 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RBBP7Q16576 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RBBP7Q16576 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RBBP7Q16576 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RBBP7Q16576 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RBBP7Q16576 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RBBP7Q16576 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RBBP7Q16576 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RBBP7Q16576 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RBBP7Q16576 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RBBP7Q16576 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RBBP7Q16576 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RBBP7Q16576 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RBBP7Q16576 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RBBP7Q16576 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RBBP7Q16576 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RBBP7Q16576 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RBBP7Q16576 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RBBP7Q16576 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RBBP7Q16576 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RBBP7Q16576 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RBBP7Q16576 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RBBP7Q16576 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RBBP7Q16576 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RBBP7Q16576 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RBBP7Q16576 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RBBP7Q16576 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RBBP7Q16576 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RBBP7Q16576 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RBBP7Q16576 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RBBP7Q16576 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RBBP7Q16576 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RBBP7Q16576 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RBBP7Q16576 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RBBP7Q16576 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RBBP7Q16576 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RBBP7Q16576 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RBBP7Q16576 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RBBP7Q16576 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RBBP7Q16576 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RBBP7Q16576 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RBBP7Q16576 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RBBP7Q16576 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RBBP7Q16576 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RBBP7Q16576 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RBBP7Q16576 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RBBP7Q16576 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RBBP7Q16576 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RBBP7Q16576 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RBBP7Q16576 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
RBBP7Q16576 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RBBP7Q16576 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RBBP7Q16576 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RBBP7Q16576 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RBBP7Q16576 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RBBP7Q16576 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RBBP7Q16576 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RBBP7Q16576 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RBBP7Q16576 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RBBP7Q16576 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RBBP7Q16576 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RBBP7Q16576 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RBBP7Q16576 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RBBP7Q16576 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
RBBP7Q16576 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RBBP7Q16576 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RBBP7Q16576 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RBBP7Q16576 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RBBP7Q16576 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RBBP7Q16576 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RBBP7Q16576 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
RBBP7Q16576 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RBBP7Q16576 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RBBP7Q16576 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RBBP7Q16576 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RBBP7Q16576 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RBBP7Q16576 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RBBP7Q16576 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RBBP7Q16576 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RBBP7Q16576 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RBBP7Q16576 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RBBP7Q16576 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RBBP7Q16576 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RBBP7Q16576 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RBBP7Q16576 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RBBP7Q16576 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RBBP7Q16576 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RBBP7Q16576 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RBBP7Q16576 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RBBP7Q16576 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RBBP7Q16576 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RBBP7Q16576 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RBBP7Q16576 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RBBP7Q16576 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.5 ms