Protein–RNA interactions for Protein: Q16568

CARTPT, Cocaine- and amphetamine-regulated transcript protein, humanhuman

Predictions only

Length 116 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARTPTQ16568 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CARTPTQ16568 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CARTPTQ16568 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CARTPTQ16568 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CARTPTQ16568 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CARTPTQ16568 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CARTPTQ16568 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CARTPTQ16568 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CARTPTQ16568 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CARTPTQ16568 GRAMD4-202ENST00000406902 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CARTPTQ16568 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CARTPTQ16568 RTF1-201ENST00000389629 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CARTPTQ16568 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
CARTPTQ16568 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CARTPTQ16568 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CARTPTQ16568 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CARTPTQ16568 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CARTPTQ16568 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CARTPTQ16568 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CARTPTQ16568 PPP6R2-204ENST00000395744 3293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CARTPTQ16568 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CARTPTQ16568 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CARTPTQ16568 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CARTPTQ16568 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CARTPTQ16568 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CARTPTQ16568 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CARTPTQ16568 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CARTPTQ16568 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CARTPTQ16568 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CARTPTQ16568 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CARTPTQ16568 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CARTPTQ16568 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CARTPTQ16568 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CARTPTQ16568 COQ8A-203ENST00000366779 5523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CARTPTQ16568 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CARTPTQ16568 GALNT3-201ENST00000392701 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CARTPTQ16568 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CARTPTQ16568 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CARTPTQ16568 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CARTPTQ16568 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
CARTPTQ16568 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CARTPTQ16568 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CARTPTQ16568 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CARTPTQ16568 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CARTPTQ16568 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CARTPTQ16568 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CARTPTQ16568 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CARTPTQ16568 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CARTPTQ16568 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
CARTPTQ16568 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CARTPTQ16568 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CARTPTQ16568 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CARTPTQ16568 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CARTPTQ16568 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CARTPTQ16568 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CARTPTQ16568 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CARTPTQ16568 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CARTPTQ16568 TCHH-201ENST00000368804 6900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CARTPTQ16568 RBM6-201ENST00000266022 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CARTPTQ16568 AC087386.2-201ENST00000623212 4637 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
CARTPTQ16568 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CARTPTQ16568 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CARTPTQ16568 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CARTPTQ16568 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CARTPTQ16568 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CARTPTQ16568 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CARTPTQ16568 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CARTPTQ16568 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
CARTPTQ16568 NFKB2-204ENST00000428099 3416 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CARTPTQ16568 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CARTPTQ16568 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CARTPTQ16568 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CARTPTQ16568 AC093668.2-201ENST00000481893 3569 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CARTPTQ16568 AC105052.1-201ENST00000519541 3569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CARTPTQ16568 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CARTPTQ16568 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CARTPTQ16568 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CARTPTQ16568 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CARTPTQ16568 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CARTPTQ16568 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CARTPTQ16568 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
CARTPTQ16568 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
CARTPTQ16568 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CARTPTQ16568 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CARTPTQ16568 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CARTPTQ16568 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CARTPTQ16568 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CARTPTQ16568 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CARTPTQ16568 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CARTPTQ16568 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
CARTPTQ16568 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CARTPTQ16568 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
CARTPTQ16568 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CARTPTQ16568 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CARTPTQ16568 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CARTPTQ16568 SLC4A7-207ENST00000437179 3667 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CARTPTQ16568 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CARTPTQ16568 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CARTPTQ16568 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CARTPTQ16568 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms