Protein–RNA interactions for Protein: Q16445

GABRA6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA6Q16445 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
GABRA6Q16445 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
GABRA6Q16445 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
GABRA6Q16445 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
GABRA6Q16445 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
GABRA6Q16445 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
GABRA6Q16445 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
GABRA6Q16445 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
GABRA6Q16445 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
GABRA6Q16445 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
GABRA6Q16445 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
GABRA6Q16445 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
GABRA6Q16445 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
GABRA6Q16445 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
GABRA6Q16445 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
GABRA6Q16445 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
GABRA6Q16445 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
GABRA6Q16445 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
GABRA6Q16445 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
GABRA6Q16445 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
GABRA6Q16445 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
GABRA6Q16445 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
GABRA6Q16445 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
GABRA6Q16445 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC13.72□□□□□ -0.21
GABRA6Q16445 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
GABRA6Q16445 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
GABRA6Q16445 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
GABRA6Q16445 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
GABRA6Q16445 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
GABRA6Q16445 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
GABRA6Q16445 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
GABRA6Q16445 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
GABRA6Q16445 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
GABRA6Q16445 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
GABRA6Q16445 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
GABRA6Q16445 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
GABRA6Q16445 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
GABRA6Q16445 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
GABRA6Q16445 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
GABRA6Q16445 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
GABRA6Q16445 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
GABRA6Q16445 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
GABRA6Q16445 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
GABRA6Q16445 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
GABRA6Q16445 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
GABRA6Q16445 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
GABRA6Q16445 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
GABRA6Q16445 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
GABRA6Q16445 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
GABRA6Q16445 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
GABRA6Q16445 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
GABRA6Q16445 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
GABRA6Q16445 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
GABRA6Q16445 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
GABRA6Q16445 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
GABRA6Q16445 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
GABRA6Q16445 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
GABRA6Q16445 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
GABRA6Q16445 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
GABRA6Q16445 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
GABRA6Q16445 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
GABRA6Q16445 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
GABRA6Q16445 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
GABRA6Q16445 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
GABRA6Q16445 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
GABRA6Q16445 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
GABRA6Q16445 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
GABRA6Q16445 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
GABRA6Q16445 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
GABRA6Q16445 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
GABRA6Q16445 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
GABRA6Q16445 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
GABRA6Q16445 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
GABRA6Q16445 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
GABRA6Q16445 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
GABRA6Q16445 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.71□□□□□ -0.21
GABRA6Q16445 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
GABRA6Q16445 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
GABRA6Q16445 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
GABRA6Q16445 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
GABRA6Q16445 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
GABRA6Q16445 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
GABRA6Q16445 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
GABRA6Q16445 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
GABRA6Q16445 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
GABRA6Q16445 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
GABRA6Q16445 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
GABRA6Q16445 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
GABRA6Q16445 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
GABRA6Q16445 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
GABRA6Q16445 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
GABRA6Q16445 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
GABRA6Q16445 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
GABRA6Q16445 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
GABRA6Q16445 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
GABRA6Q16445 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
GABRA6Q16445 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
GABRA6Q16445 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
GABRA6Q16445 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
GABRA6Q16445 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms