Protein–RNA interactions for Protein: Q16288

NTRK3, NT-3 growth factor receptor, humanhuman

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Length 839 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK3Q16288 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NTRK3Q16288 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NTRK3Q16288 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NTRK3Q16288 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NTRK3Q16288 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NTRK3Q16288 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NTRK3Q16288 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NTRK3Q16288 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NTRK3Q16288 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NTRK3Q16288 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NTRK3Q16288 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
NTRK3Q16288 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NTRK3Q16288 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
NTRK3Q16288 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NTRK3Q16288 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
NTRK3Q16288 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
NTRK3Q16288 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NTRK3Q16288 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NTRK3Q16288 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NTRK3Q16288 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NTRK3Q16288 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NTRK3Q16288 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
NTRK3Q16288 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NTRK3Q16288 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NTRK3Q16288 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NTRK3Q16288 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NTRK3Q16288 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NTRK3Q16288 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NTRK3Q16288 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NTRK3Q16288 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NTRK3Q16288 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NTRK3Q16288 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NTRK3Q16288 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NTRK3Q16288 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NTRK3Q16288 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NTRK3Q16288 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NTRK3Q16288 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NTRK3Q16288 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NTRK3Q16288 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NTRK3Q16288 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NTRK3Q16288 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NTRK3Q16288 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NTRK3Q16288 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NTRK3Q16288 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
NTRK3Q16288 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NTRK3Q16288 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NTRK3Q16288 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NTRK3Q16288 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NTRK3Q16288 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NTRK3Q16288 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NTRK3Q16288 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NTRK3Q16288 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NTRK3Q16288 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
NTRK3Q16288 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NTRK3Q16288 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NTRK3Q16288 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NTRK3Q16288 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NTRK3Q16288 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NTRK3Q16288 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
NTRK3Q16288 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
NTRK3Q16288 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
NTRK3Q16288 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NTRK3Q16288 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
NTRK3Q16288 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
NTRK3Q16288 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
NTRK3Q16288 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
NTRK3Q16288 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
NTRK3Q16288 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
NTRK3Q16288 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NTRK3Q16288 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NTRK3Q16288 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NTRK3Q16288 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
NTRK3Q16288 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NTRK3Q16288 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NTRK3Q16288 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NTRK3Q16288 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NTRK3Q16288 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NTRK3Q16288 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NTRK3Q16288 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NTRK3Q16288 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NTRK3Q16288 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NTRK3Q16288 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NTRK3Q16288 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NTRK3Q16288 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NTRK3Q16288 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NTRK3Q16288 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NTRK3Q16288 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NTRK3Q16288 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
NTRK3Q16288 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
NTRK3Q16288 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NTRK3Q16288 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NTRK3Q16288 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NTRK3Q16288 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NTRK3Q16288 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
NTRK3Q16288 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NTRK3Q16288 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NTRK3Q16288 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NTRK3Q16288 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NTRK3Q16288 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NTRK3Q16288 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
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