Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CNGA3Q16281 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CNGA3Q16281 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CNGA3Q16281 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CNGA3Q16281 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CNGA3Q16281 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CNGA3Q16281 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CNGA3Q16281 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CNGA3Q16281 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CNGA3Q16281 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CNGA3Q16281 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CNGA3Q16281 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CNGA3Q16281 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CNGA3Q16281 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CNGA3Q16281 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CNGA3Q16281 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CNGA3Q16281 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CNGA3Q16281 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CNGA3Q16281 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CNGA3Q16281 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CNGA3Q16281 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CNGA3Q16281 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CNGA3Q16281 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CNGA3Q16281 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CNGA3Q16281 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CNGA3Q16281 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CNGA3Q16281 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CNGA3Q16281 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CNGA3Q16281 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CNGA3Q16281 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CNGA3Q16281 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CNGA3Q16281 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CNGA3Q16281 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CNGA3Q16281 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CNGA3Q16281 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CNGA3Q16281 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CNGA3Q16281 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CNGA3Q16281 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CNGA3Q16281 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CNGA3Q16281 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CNGA3Q16281 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CNGA3Q16281 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CNGA3Q16281 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
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CNGA3Q16281 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
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CNGA3Q16281 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CNGA3Q16281 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CNGA3Q16281 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
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CNGA3Q16281 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
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CNGA3Q16281 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CNGA3Q16281 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CNGA3Q16281 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
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CNGA3Q16281 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CNGA3Q16281 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CNGA3Q16281 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CNGA3Q16281 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CNGA3Q16281 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CNGA3Q16281 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CNGA3Q16281 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CNGA3Q16281 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CNGA3Q16281 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CNGA3Q16281 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CNGA3Q16281 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CNGA3Q16281 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CNGA3Q16281 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CNGA3Q16281 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CNGA3Q16281 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CNGA3Q16281 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CNGA3Q16281 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CNGA3Q16281 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CNGA3Q16281 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CNGA3Q16281 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CNGA3Q16281 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CNGA3Q16281 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CNGA3Q16281 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CNGA3Q16281 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CNGA3Q16281 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
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