Protein–RNA interactions for Protein: Q16099

GRIK4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK4Q16099 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GRIK4Q16099 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
GRIK4Q16099 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GRIK4Q16099 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GRIK4Q16099 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GRIK4Q16099 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GRIK4Q16099 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GRIK4Q16099 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GRIK4Q16099 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GRIK4Q16099 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GRIK4Q16099 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GRIK4Q16099 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GRIK4Q16099 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GRIK4Q16099 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GRIK4Q16099 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GRIK4Q16099 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GRIK4Q16099 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GRIK4Q16099 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GRIK4Q16099 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GRIK4Q16099 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GRIK4Q16099 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GRIK4Q16099 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GRIK4Q16099 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GRIK4Q16099 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GRIK4Q16099 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GRIK4Q16099 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GRIK4Q16099 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GRIK4Q16099 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GRIK4Q16099 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GRIK4Q16099 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GRIK4Q16099 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GRIK4Q16099 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GRIK4Q16099 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GRIK4Q16099 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
GRIK4Q16099 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
GRIK4Q16099 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GRIK4Q16099 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GRIK4Q16099 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GRIK4Q16099 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GRIK4Q16099 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GRIK4Q16099 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
GRIK4Q16099 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
GRIK4Q16099 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GRIK4Q16099 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GRIK4Q16099 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
GRIK4Q16099 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GRIK4Q16099 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GRIK4Q16099 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GRIK4Q16099 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GRIK4Q16099 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GRIK4Q16099 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GRIK4Q16099 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GRIK4Q16099 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GRIK4Q16099 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GRIK4Q16099 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
GRIK4Q16099 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GRIK4Q16099 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GRIK4Q16099 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
GRIK4Q16099 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
GRIK4Q16099 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
GRIK4Q16099 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GRIK4Q16099 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GRIK4Q16099 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GRIK4Q16099 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GRIK4Q16099 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
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GRIK4Q16099 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GRIK4Q16099 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GRIK4Q16099 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GRIK4Q16099 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GRIK4Q16099 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GRIK4Q16099 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
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GRIK4Q16099 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GRIK4Q16099 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GRIK4Q16099 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GRIK4Q16099 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GRIK4Q16099 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GRIK4Q16099 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GRIK4Q16099 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GRIK4Q16099 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GRIK4Q16099 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GRIK4Q16099 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GRIK4Q16099 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GRIK4Q16099 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GRIK4Q16099 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GRIK4Q16099 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GRIK4Q16099 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GRIK4Q16099 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GRIK4Q16099 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GRIK4Q16099 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GRIK4Q16099 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GRIK4Q16099 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GRIK4Q16099 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GRIK4Q16099 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GRIK4Q16099 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GRIK4Q16099 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
GRIK4Q16099 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GRIK4Q16099 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GRIK4Q16099 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
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